More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0647 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
264 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  56.37 
 
 
263 aa  281  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  55.47 
 
 
267 aa  275  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  52.9 
 
 
270 aa  275  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 
270 aa  275  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  53.67 
 
 
270 aa  275  8e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  61.48 
 
 
266 aa  274  9e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  54.05 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  54.05 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  54.05 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  54.05 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  52.73 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 
270 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  55.86 
 
 
267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  53.67 
 
 
270 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  59.77 
 
 
266 aa  271  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  51.56 
 
 
272 aa  271  7e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  54.92 
 
 
490 aa  267  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  58.66 
 
 
285 aa  267  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  52.73 
 
 
267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  51.95 
 
 
262 aa  265  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  56.64 
 
 
283 aa  261  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  53.49 
 
 
436 aa  261  6.999999999999999e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 
270 aa  260  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  54.58 
 
 
268 aa  255  5e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 
270 aa  254  8e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  52.9 
 
 
260 aa  254  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  52.92 
 
 
497 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  48.83 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  48.83 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  59.14 
 
 
267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  55.21 
 
 
264 aa  251  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  52.16 
 
 
271 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  52.09 
 
 
264 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  51.25 
 
 
497 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  49.04 
 
 
269 aa  246  4e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  53.94 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
260 aa  244  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  46.27 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  46.27 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  51.76 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  54.96 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  49.02 
 
 
265 aa  243  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  45.88 
 
 
270 aa  242  5e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
268 aa  239  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  48.3 
 
 
266 aa  239  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  49.79 
 
 
492 aa  238  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  51.52 
 
 
268 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  47.96 
 
 
267 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  51.33 
 
 
268 aa  238  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  48.13 
 
 
290 aa  238  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 
266 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 
257 aa  236  2e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  52.36 
 
 
479 aa  236  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
267 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  47.55 
 
 
266 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 
268 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 
263 aa  236  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 
266 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 
266 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 
266 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
288 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 
267 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  47.17 
 
 
266 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  47.17 
 
 
266 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 
268 aa  235  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.04 
 
 
271 aa  234  8e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  48.75 
 
 
484 aa  234  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 
279 aa  234  8e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  47.93 
 
 
275 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 
266 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  51.19 
 
 
444 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  50.59 
 
 
450 aa  232  5e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  49.17 
 
 
484 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
282 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
282 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
282 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 
266 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 
266 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 
266 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 
266 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  49.58 
 
 
266 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 
266 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 
266 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 
266 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 
266 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  49.38 
 
 
271 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 
276 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  45.56 
 
 
274 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  46.99 
 
 
266 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  52.14 
 
 
283 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  46.64 
 
 
264 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 
276 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  45.56 
 
 
274 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  45.56 
 
 
274 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  45.56 
 
 
274 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  45.56 
 
 
274 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  45.56 
 
 
274 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>