More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0641 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 1648 aa  3362    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.72 
 
 		 218 aa  259  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.75 
 
 		 218 aa  253  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.99 
 
 		 456 aa  230  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 856 aa  215  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.56 
 
 		 464 aa  200  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.93 
 
 		 231 aa  186  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  45.58 
 
 		 234 aa  184  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 237 aa  180  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 1301 aa  180  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  43.19 
 
 		 217 aa  177  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 237 aa  177  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 213 aa  177  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.47 
 
 		 224 aa  174  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.72 
 
 		 253 aa  174  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 217 aa  171  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 236 aa  171  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  40.76 
 
 		 221 aa  170  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  43.98 
 
 		 234 aa  168  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 218 aa  167  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 218 aa  167  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 303 aa  165  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 238 aa  165  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 		 225 aa  163  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  43.33 
 
 		 213 aa  162  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 250 aa  162  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  40 
 
 		 222 aa  162  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.27 
 
 		 228 aa  160  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.98 
 
 		 225 aa  161  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  41.86 
 
 		 216 aa  160  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.16 
 
 		 1094 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 229 aa  160  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 216 aa  159  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 		 217 aa  160  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 216 aa  159  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.55 
 
 		 243 aa  159  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.32 
 
 		 222 aa  159  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  39.27 
 
 		 242 aa  157  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 220 aa  158  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  27.31 
 
 		 595 aa  157  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 214 aa  157  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 1262 aa  156  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  27.42 
 
 		 592 aa  155  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  26.96 
 
 		 597 aa  155  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 213 aa  155  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.35 
 
 		 211 aa  155  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 241 aa  154  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  26.62 
 
 		 595 aa  154  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 216 aa  154  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 1039 aa  154  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 216 aa  154  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  40.67 
 
 		 227 aa  154  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.91 
 
 		 1258 aa  154  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 222 aa  154  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 218 aa  154  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.12 
 
 		 230 aa  153  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 220 aa  153  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 216 aa  153  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 1177 aa  153  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 595 aa  153  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 242 aa  153  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 1069 aa  152  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 206 aa  152  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 217 aa  152  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.7 
 
 		 239 aa  152  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 212 aa  152  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 225 aa  152  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 212 aa  152  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 1568 aa  151  9e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 225 aa  151  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 215 aa  151  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 227 aa  151  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  26.93 
 
 		 1207 aa  151  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1618  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 220 aa  151  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 211 aa  150  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 224 aa  150  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 234 aa  150  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 242 aa  150  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 223 aa  150  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.2 
 
 		 226 aa  150  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.37 
 
 		 227 aa  149  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.22 
 
 		 236 aa  150  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 220 aa  149  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 221 aa  149  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  36.32 
 
 		 216 aa  149  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 221 aa  149  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 212 aa  149  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 224 aa  149  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 223 aa  149  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 232 aa  149  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 227 aa  149  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.76 
 
 		 1331 aa  148  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 222 aa  148  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 217 aa  148  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  36.73 
 
 		 233 aa  148  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 224 aa  148  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  36.73 
 
 		 233 aa  148  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  36.73 
 
 		 233 aa  148  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2686  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  36.73 
 
 		 233 aa  148  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1519  DNA-binding response regulator NarL  36.73 
 
 		 233 aa  148  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.281442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>