264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0580 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  100 
 
 
226 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  38.65 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  36.59 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  38.73 
 
 
306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0854  siroheme synthase  36.1 
 
 
221 aa  128  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.819849  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  32.85 
 
 
225 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  36.99 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  41.1 
 
 
209 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  40.23 
 
 
235 aa  122  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  39.76 
 
 
230 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.49 
 
 
472 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  40.85 
 
 
224 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.27 
 
 
473 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  34.59 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  41.83 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.23 
 
 
462 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  34.15 
 
 
213 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.48 
 
 
480 aa  115  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  39.51 
 
 
255 aa  115  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.48 
 
 
480 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.38 
 
 
476 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  34.34 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.24 
 
 
479 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  36.02 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  38.75 
 
 
280 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  40 
 
 
200 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  33.7 
 
 
190 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  43.29 
 
 
224 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  33.98 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.96 
 
 
464 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.28 
 
 
487 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  36.97 
 
 
312 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  38.89 
 
 
224 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  36.77 
 
 
626 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  34.12 
 
 
464 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  33.96 
 
 
465 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  33.96 
 
 
465 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  33.18 
 
 
464 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  39.35 
 
 
194 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  30.2 
 
 
212 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.5 
 
 
472 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  31.5 
 
 
472 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  31.5 
 
 
472 aa  105  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.63 
 
 
464 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  35.78 
 
 
303 aa  104  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  31.05 
 
 
198 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  29.61 
 
 
321 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  37.35 
 
 
220 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  32.02 
 
 
226 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  32.95 
 
 
313 aa  102  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  32.94 
 
 
257 aa  101  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.58 
 
 
502 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  33.98 
 
 
303 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  26.7 
 
 
314 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  33.98 
 
 
303 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  33.98 
 
 
303 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  33.98 
 
 
303 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  32.99 
 
 
303 aa  99.8  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  40 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  32.57 
 
 
473 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  32.57 
 
 
473 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  37.04 
 
 
303 aa  98.6  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.97 
 
 
462 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.03 
 
 
528 aa  98.6  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.49 
 
 
554 aa  98.2  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  35.8 
 
 
303 aa  98.2  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.52 
 
 
458 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  35.4 
 
 
303 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  30.26 
 
 
468 aa  96.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  29.32 
 
 
182 aa  96.3  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  35.48 
 
 
493 aa  96.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  32.88 
 
 
470 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  34.97 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  32.47 
 
 
303 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  35.58 
 
 
474 aa  95.1  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  32.47 
 
 
303 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  32.47 
 
 
303 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  29.11 
 
 
472 aa  95.1  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  29.38 
 
 
205 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  30.48 
 
 
462 aa  93.6  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  31.93 
 
 
229 aa  92.8  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  35.8 
 
 
303 aa  92.8  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  32.99 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  35.61 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06710  siroheme synthase Met8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05680)  34.19 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  32.62 
 
 
204 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.64 
 
 
482 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  27.96 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  36.53 
 
 
197 aa  90.1  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.22 
 
 
481 aa  89.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  30.28 
 
 
459 aa  88.6  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3166  precorrin-2 dehydrogenase  32 
 
 
157 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  27.51 
 
 
193 aa  88.6  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  26.98 
 
 
195 aa  88.2  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  32.53 
 
 
467 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  30.48 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.95 
 
 
480 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  31.38 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  33.33 
 
 
303 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  30.48 
 
 
457 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>