More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0514 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  51.53 
 
 
193 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  41.11 
 
 
198 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  42.11 
 
 
197 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  41.92 
 
 
197 aa  145  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  42.51 
 
 
197 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  42.04 
 
 
231 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  41.4 
 
 
204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  37.87 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 
203 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 
187 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  42.31 
 
 
203 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  40.65 
 
 
206 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 
204 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  41.45 
 
 
199 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  37.8 
 
 
201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  40.13 
 
 
196 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  37.82 
 
 
198 aa  135  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  42.95 
 
 
205 aa  134  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  43.59 
 
 
205 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  42.95 
 
 
205 aa  134  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  40.49 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  42.31 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 
194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  42.95 
 
 
213 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  41.29 
 
 
205 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  41.29 
 
 
205 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  41.29 
 
 
205 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  41.29 
 
 
205 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  41.29 
 
 
205 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 
201 aa  131  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  43.12 
 
 
211 aa  131  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 
191 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  41.29 
 
 
181 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  41.29 
 
 
181 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  40.65 
 
 
181 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  34.84 
 
 
221 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  37.18 
 
 
209 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  36.5 
 
 
203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  40.13 
 
 
264 aa  128  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  40.13 
 
 
199 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  35.93 
 
 
197 aa  128  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 
204 aa  128  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  40.91 
 
 
200 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  36.63 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  37.24 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  38.18 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 
191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  36.36 
 
 
220 aa  125  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  40.13 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  36.47 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 
197 aa  124  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  36.73 
 
 
210 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 
197 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  38.22 
 
 
208 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 
205 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 
210 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 
220 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  35.88 
 
 
217 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  37.31 
 
 
211 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  36.71 
 
 
275 aa  121  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  35.2 
 
 
210 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
204 aa  121  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  38.55 
 
 
226 aa  121  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  36.67 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 
211 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  37.56 
 
 
211 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  38.55 
 
 
200 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  36.18 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 
211 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 
211 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  34.69 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  38 
 
 
188 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 
226 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  37.74 
 
 
218 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 
208 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 
202 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  38.31 
 
 
221 aa  118  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  37.11 
 
 
219 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  37.11 
 
 
219 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  36.2 
 
 
199 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  37.11 
 
 
232 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  37.11 
 
 
232 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  37.11 
 
 
232 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  37.11 
 
 
232 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  36.67 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  31.9 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  34.87 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  34.3 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>