More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0495 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
775 aa  1568  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.09 
 
 
671 aa  314  4e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.18475e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  32.83 
 
 
646 aa  307  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  34.32 
 
 
610 aa  287  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  4.26063e-07 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  32.93 
 
 
619 aa  286  1e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  31.46 
 
 
634 aa  286  1e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  7.85776e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  33.62 
 
 
618 aa  284  4e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  1.09983e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 
618 aa  284  4e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 
618 aa  284  4e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.07443e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 
618 aa  284  4e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.42864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  33.91 
 
 
643 aa  283  7e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  34.71 
 
 
611 aa  283  9e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 
645 aa  283  9e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  33.63 
 
 
574 aa  282  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  34.64 
 
 
596 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  33.05 
 
 
617 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 
610 aa  281  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  34.46 
 
 
646 aa  281  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  32.7 
 
 
617 aa  280  7e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 
618 aa  279  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  7.90878e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 
627 aa  279  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 
618 aa  276  8e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.24923e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  30.05 
 
 
716 aa  276  1e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  1.7381e-06 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  31.42 
 
 
628 aa  276  1e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0673  penicillin-binding protein 2  31.21 
 
 
669 aa  276  1e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.810569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  32.81 
 
 
637 aa  275  2e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  34.1 
 
 
646 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  33.86 
 
 
618 aa  274  4e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  9.00115e-07  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 
630 aa  274  4e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  33.86 
 
 
618 aa  274  4e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  33.68 
 
 
618 aa  274  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.94498e-05  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.68 
 
 
618 aa  274  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  32.81 
 
 
634 aa  273  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  31.59 
 
 
612 aa  273  7e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.64685e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  31.59 
 
 
615 aa  273  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 
678 aa  273  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 
618 aa  272  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  7.5861e-05  unclonable  1.00578e-10 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  32.71 
 
 
618 aa  271  3e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.72636e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  32.39 
 
 
631 aa  271  3e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 
618 aa  270  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  32.17 
 
 
664 aa  270  5e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  32.22 
 
 
631 aa  270  6e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.56 
 
 
645 aa  270  6e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  31.93 
 
 
662 aa  270  7e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  32.83 
 
 
800 aa  270  9e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  32.22 
 
 
629 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.8 
 
 
647 aa  269  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 
619 aa  270  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
626 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  31.88 
 
 
629 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  34.4 
 
 
600 aa  269  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  32.5 
 
 
630 aa  268  3e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  32.19 
 
 
681 aa  267  6e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 
633 aa  266  9e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  32.47 
 
 
646 aa  266  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.9 
 
 
639 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  32.04 
 
 
629 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0235  penicillin-binding protein 2  32.52 
 
 
621 aa  266  1e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  34.33 
 
 
605 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 
629 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.99 
 
 
636 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  31.34 
 
 
618 aa  263  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 
631 aa  263  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  35.37 
 
 
627 aa  262  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  31.67 
 
 
652 aa  262  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  31.63 
 
 
640 aa  262  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 
636 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 
637 aa  261  3e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  34.86 
 
 
701 aa  261  5e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 
643 aa  260  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  31.26 
 
 
636 aa  260  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0443  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.41 
 
 
673 aa  260  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  31.94 
 
 
634 aa  259  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  33.11 
 
 
801 aa  259  9e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  32.42 
 
 
809 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  32.48 
 
 
802 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  32.48 
 
 
802 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  32.04 
 
 
633 aa  259  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  32.48 
 
 
802 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  32.48 
 
 
802 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 
632 aa  259  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1260  penicillin-binding protein 2  29.78 
 
 
724 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.022216  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  31.47 
 
 
609 aa  259  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  32.75 
 
 
631 aa  259  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  32.42 
 
 
803 aa  259  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  32.57 
 
 
631 aa  259  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  32.25 
 
 
775 aa  259  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  32.43 
 
 
802 aa  259  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  31.79 
 
 
633 aa  258  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.49016e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 
793 aa  258  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  32.75 
 
 
631 aa  258  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  31.91 
 
 
761 aa  258  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  31.79 
 
 
633 aa  257  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  31.79 
 
 
633 aa  257  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.10034e-05  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  31.79 
 
 
633 aa  257  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.98209e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  31.79 
 
 
633 aa  257  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  31.79 
 
 
633 aa  257  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  31.79 
 
 
633 aa  257  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.14363e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  31.79 
 
 
633 aa  257  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.71681e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  31.79 
 
 
633 aa  257  7e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.4384e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>