More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0286 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 419 aa  863    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  36.93 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.1 
 
 		 464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  37.88 
 
 		 453 aa  272  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  36.78 
 
 		 464 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  34.8 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  34.29 
 
 		 441 aa  263  3e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  36.54 
 
 		 458 aa  263  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  37.69 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  37.56 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  36.57 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  36 
 
 		 440 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  35.7 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  34.96 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  35.44 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  34.61 
 
 		 425 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  34.05 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 		 446 aa  250  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.99 
 
 		 434 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  34.94 
 
 		 428 aa  249  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  35.79 
 
 		 430 aa  249  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  34.29 
 
 		 425 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  34.27 
 
 		 434 aa  249  9e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.49 
 
 		 441 aa  249  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  34.94 
 
 		 422 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  34.4 
 
 		 444 aa  249  9e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  35.38 
 
 		 432 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  35.24 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.99 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  36.96 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  36.53 
 
 		 420 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  34.7 
 
 		 422 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 		 422 aa  246  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  34.99 
 
 		 440 aa  246  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  34.13 
 
 		 425 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  35.37 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  34.23 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  33.89 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  37.97 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  33.66 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  34.46 
 
 		 421 aa  244  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  35.25 
 
 		 408 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  33.98 
 
 		 426 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  37.72 
 
 		 420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.78 
 
 		 461 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  34.34 
 
 		 418 aa  243  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  36.1 
 
 		 432 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  35.38 
 
 		 419 aa  242  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  35.68 
 
 		 420 aa  242  9e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 		 451 aa  242  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  35.25 
 
 		 446 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 425 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  35.38 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 444 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 444 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  34.59 
 
 		 454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 444 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  34.76 
 
 		 442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 		 443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 444 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  34.06 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  34.92 
 
 		 446 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  36.08 
 
 		 418 aa  239  5.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 444 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  37.28 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  36.01 
 
 		 432 aa  237  3e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  37.28 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  32.62 
 
 		 432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  35.54 
 
 		 428 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 		 432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 		 432 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 		 432 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  35.77 
 
 		 436 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  32.62 
 
 		 432 aa  236  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  37.04 
 
 		 418 aa  235  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  37.04 
 
 		 418 aa  235  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  37.04 
 
 		 418 aa  235  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  37.04 
 
 		 418 aa  235  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  36.48 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  34.23 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  36.54 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  32.62 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  34.01 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  34.39 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  32.3 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  35.24 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  33.97 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>