More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0278 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  100 
 
 
252 aa  512  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  65.02 
 
 
230 aa  301  8.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0180  ABC transporter related  64.71 
 
 
231 aa  285  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0585319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  58.3 
 
 
565 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  54.4 
 
 
563 aa  265  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  54.46 
 
 
247 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  50.22 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  52.47 
 
 
240 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  50.22 
 
 
240 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  48.9 
 
 
266 aa  228  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  50.22 
 
 
240 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  50.22 
 
 
240 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  50.67 
 
 
241 aa  228  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  50.88 
 
 
455 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  49.78 
 
 
255 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.6 
 
 
239 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  47.35 
 
 
253 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  50.45 
 
 
249 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  50.89 
 
 
237 aa  222  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  50.45 
 
 
225 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  48 
 
 
244 aa  221  7e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  49.55 
 
 
225 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  47.95 
 
 
237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  50.44 
 
 
241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 
222 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.36 
 
 
234 aa  219  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.79 
 
 
230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  51.36 
 
 
240 aa  218  5e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  48.87 
 
 
229 aa  218  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.73 
 
 
224 aa  217  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  47.75 
 
 
235 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  48 
 
 
248 aa  217  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  48.4 
 
 
240 aa  216  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
230 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  47.49 
 
 
228 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  51.6 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  51.6 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  50.91 
 
 
445 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.42 
 
 
225 aa  216  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  48.64 
 
 
236 aa  215  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  48.64 
 
 
237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  48.64 
 
 
237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  48.88 
 
 
253 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  46.7 
 
 
255 aa  215  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  48.18 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  48.18 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 
228 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.51 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  47.75 
 
 
221 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  48.4 
 
 
242 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  45.89 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  49.54 
 
 
227 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  53.42 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26100  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.77 
 
 
232 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723812  normal  0.918688 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  50.67 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  49.78 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
224 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  47.3 
 
 
653 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  49.05 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  48.43 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
224 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  48.61 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  50 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  48.66 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.09 
 
 
228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 
235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.12 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 
224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  48.67 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  47.27 
 
 
224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
240 aa  212  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  44.26 
 
 
242 aa  212  5.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  48.4 
 
 
288 aa  211  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.95 
 
 
230 aa  211  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  50.93 
 
 
237 aa  211  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
232 aa  211  9e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  47.27 
 
 
224 aa  211  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.65 
 
 
234 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  45.96 
 
 
264 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.66 
 
 
226 aa  211  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  45.98 
 
 
226 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.65 
 
 
234 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  49.07 
 
 
253 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  48.87 
 
 
238 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  46.88 
 
 
241 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  47.56 
 
 
226 aa  209  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  47.49 
 
 
242 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  47.73 
 
 
229 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  47.51 
 
 
253 aa  209  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
220 aa  209  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  47.75 
 
 
258 aa  209  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  46.82 
 
 
224 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
229 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>