More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0262 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 407 aa  823    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  44.41 
 
 		 422 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  44.7 
 
 		 422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  25.34 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  26.38 
 
 		 432 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  27.91 
 
 		 475 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  25.62 
 
 		 774 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  25.31 
 
 		 653 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  25.77 
 
 		 431 aa  96.7  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  25.48 
 
 		 652 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  25.6 
 
 		 963 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 		 687 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3105  Pyrrolo-quinoline quinone  24.64 
 
 		 453 aa  92  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  23.77 
 
 		 556 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  25.84 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  27 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  24.75 
 
 		 1812 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  24.05 
 
 		 795 aa  80.9  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  23.3 
 
 		 797 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  25.54 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  25.54 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  26.57 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.59 
 
 		 611 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3153  hypothetical protein  25.7 
 
 		 637 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0308733  normal  0.0661061 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  25.09 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  24.31 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  23.45 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  25.53 
 
 		 1454 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  25.18 
 
 		 1241 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1067 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  26.54 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  25.55 
 
 		 1328 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  24.72 
 
 		 514 aa  70.1  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  23.08 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  23.2 
 
 		 448 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  22.25 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  24.25 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  24.25 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  23.11 
 
 		 901 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.43 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  23.83 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  26.18 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  24.43 
 
 		 643 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  29.41 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  24.02 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3154  hypothetical protein  24.49 
 
 		 631 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.164464  hitchhiker  0.00920589 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  23.75 
 
 		 809 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  26.46 
 
 		 412 aa  67  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  24.93 
 
 		 611 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  24.8 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  24.77 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.8 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  26.18 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  24.69 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  24.69 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.28 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.18 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  22.22 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0750  PQQ repeat-containing protein  24.1 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.137969  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  22.33 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  25.97 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  25.21 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  22.95 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  21.51 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  26.97 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  24.19 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  24.39 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.39 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  24.39 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  22.49 
 
 		 2036 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  24.16 
 
 		 616 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1384  Pyrrolo-quinoline quinone  25.32 
 
 		 612 aa  63.2  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.868816  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  23.12 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  24.75 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  22.49 
 
 		 1969 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  23.98 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  24.53 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  23.35 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 		 619 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  23.79 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  24.75 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  24.54 
 
 		 2272 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  23.79 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  23.79 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  23.24 
 
 		 820 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1165  pyrrolo-quinoline quinone  23.42 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0116757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.98 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 820 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.4 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  23.79 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  23.79 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  23.79 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  23.79 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  25.14 
 
 		 1009 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  26.56 
 
 		 1311 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  23.46 
 
 		 789 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  26.13 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.31 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  22.38 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0522  quino protein  24.14 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>