154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0216 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  100 
 
 
441 aa  920    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  58.31 
 
 
438 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  51.13 
 
 
435 aa  458  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  51.12 
 
 
439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  47.02 
 
 
468 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  46.6 
 
 
468 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  46.68 
 
 
439 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  46.56 
 
 
449 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  45.38 
 
 
462 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  43.64 
 
 
456 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  44.24 
 
 
432 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  44.61 
 
 
474 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  42.54 
 
 
453 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  43.2 
 
 
456 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  45.19 
 
 
441 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  42.01 
 
 
457 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  44.44 
 
 
430 aa  360  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  42.28 
 
 
441 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  42.32 
 
 
437 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  42.99 
 
 
439 aa  349  7e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  40.27 
 
 
446 aa  345  8.999999999999999e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  41.14 
 
 
451 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  41.86 
 
 
432 aa  344  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  41.14 
 
 
451 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  41.14 
 
 
451 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  42.79 
 
 
438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  40.92 
 
 
451 aa  342  7e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  40.92 
 
 
451 aa  342  7e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  40.92 
 
 
451 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  40.92 
 
 
451 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  40.92 
 
 
451 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  40.86 
 
 
489 aa  338  8e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  39.82 
 
 
451 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  39.82 
 
 
451 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  39.82 
 
 
451 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  39.82 
 
 
451 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  39.82 
 
 
451 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  41.29 
 
 
438 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  40.4 
 
 
435 aa  325  9e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  39.33 
 
 
435 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  40.13 
 
 
430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  38.79 
 
 
490 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  39.78 
 
 
440 aa  310  5e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  38.48 
 
 
488 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  38.26 
 
 
488 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  38.12 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  38.36 
 
 
441 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  38.46 
 
 
443 aa  285  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  36.2 
 
 
447 aa  282  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  33.11 
 
 
426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 
426 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 
453 aa  199  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  29.5 
 
 
452 aa  190  5e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 
466 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  30 
 
 
463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  31.42 
 
 
441 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 
487 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  31.19 
 
 
441 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  29.18 
 
 
448 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  31.19 
 
 
441 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  31.19 
 
 
441 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  31.19 
 
 
441 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  31.19 
 
 
441 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  31.19 
 
 
441 aa  176  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  31.42 
 
 
441 aa  176  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  31.19 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  30.97 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  31.42 
 
 
441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  28.29 
 
 
432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  28.06 
 
 
440 aa  170  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  31.04 
 
 
447 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  28.05 
 
 
475 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  25.97 
 
 
460 aa  166  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 
436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  27.41 
 
 
476 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  26.54 
 
 
452 aa  163  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  28.19 
 
 
436 aa  160  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  27.81 
 
 
440 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  26.99 
 
 
440 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0970  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 
480 aa  153  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  29.03 
 
 
463 aa  152  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0988  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 
480 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  27.17 
 
 
441 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  25.59 
 
 
474 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  27.49 
 
 
452 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  26.05 
 
 
460 aa  150  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 
480 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  26.44 
 
 
440 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0127  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 
484 aa  143  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416914  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  25.56 
 
 
437 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 
437 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0830  glycoside hydrolase family protein  26.73 
 
 
464 aa  140  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  27.14 
 
 
485 aa  139  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 
435 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  26.91 
 
 
440 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 
440 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  26.91 
 
 
440 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  26.17 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>