More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0140 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  100 
 
 		 326 aa  678    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  28.53 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  28.48 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  27.41 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  27.89 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  28.23 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  23.88 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.85 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  27.07 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.13 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  28.97 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3397  PfkB domain protein  29.17 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.125463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  29.15 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  24.53 
 
 		 290 aa  96.7  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  27.99 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  26.43 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04860  argininosuccinate lyase  26.49 
 
 		 823 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  25.39 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  24.84 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  25.52 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  25.39 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  26.77 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  25.93 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  25.09 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  26.33 
 
 		 334 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  27.91 
 
 		 314 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3125  PfkB domain protein  29.59 
 
 		 309 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  23.75 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  26.48 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  24.28 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  27.76 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  27.63 
 
 		 373 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  23.24 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  24.08 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  24.9 
 
 		 313 aa  89.7  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  29.21 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  25.69 
 
 		 310 aa  89.4  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  26.51 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  28.99 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  26.09 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.5 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  25.86 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  26.84 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  24.33 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  25.81 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  22.81 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  22.61 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  26.73 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  22.61 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  25.45 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  26.03 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  27.01 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  24.53 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.71 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2607  PfkB domain protein  25.25 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000945109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  25.86 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  26.92 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  23.73 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  23.25 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  25.32 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  22.33 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  27.74 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  25.93 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  25.24 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  26.01 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  26.01 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  26.01 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  23.13 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  26.6 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  23.25 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  26.37 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  25.74 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  26.01 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  24.37 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  26.47 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  26.37 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  26.37 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  26.37 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  26.37 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.66 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  24.13 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  26.85 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  25.81 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  23.4 
 
 		 380 aa  79.3  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  26.47 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  24.44 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  23.73 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  25 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  25.78 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  23.51 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  26.27 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  25.38 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  24.53 
 
 		 645 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  26.2 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  25.26 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  24.5 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  30 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  23.84 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>