More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0136 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 419 aa  858    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  37.07 
 
 		 429 aa  156  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  35.84 
 
 		 432 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  37.31 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.66 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.83 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.14 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  32.65 
 
 		 435 aa  130  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  32.03 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.96 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  31.06 
 
 		 440 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.8 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  30.04 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  32.41 
 
 		 457 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  29.11 
 
 		 416 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  32.98 
 
 		 354 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  31.82 
 
 		 445 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  33.83 
 
 		 292 aa  106  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  28.25 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.42 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  36.31 
 
 		 567 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  30.36 
 
 		 434 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  36.94 
 
 		 572 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  29.64 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  31.49 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  29.91 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  29.91 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  38.26 
 
 		 437 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  29.69 
 
 		 422 aa  100  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.69 
 
 		 422 aa  100  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 		 642 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  33.33 
 
 		 395 aa  98.2  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  26.67 
 
 		 352 aa  97.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  29.23 
 
 		 451 aa  97.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1458  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.04 
 
 		 367 aa  96.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0940503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.32 
 
 		 362 aa  96.7  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 		 646 aa  96.3  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  29.64 
 
 		 449 aa  96.3  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  29.23 
 
 		 717 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  37.79 
 
 		 461 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  28.72 
 
 		 444 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  28.88 
 
 		 446 aa  93.2  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  30.43 
 
 		 615 aa  93.2  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  38.46 
 
 		 454 aa  93.2  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 969 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  29.69 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  28.16 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  29.69 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  36.59 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  29.07 
 
 		 441 aa  90.1  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  27.66 
 
 		 444 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  29.6 
 
 		 437 aa  89.7  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  29.69 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  30.83 
 
 		 425 aa  89.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.4 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  31.33 
 
 		 461 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  27.3 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  37.4 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.31 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  27.3 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  28.88 
 
 		 620 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1155  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.71 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  29.26 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  30.7 
 
 		 438 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  30.61 
 
 		 421 aa  87  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  38.93 
 
 		 446 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  34.78 
 
 		 441 aa  86.7  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.93 
 
 		 446 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.94 
 
 		 445 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 434 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  31.28 
 
 		 441 aa  86.3  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  30.88 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  30.63 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  27.17 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.17 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  27.95 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  30.13 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.54 
 
 		 661 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  30.89 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  31.08 
 
 		 944 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.93 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  30 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  37.8 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.45 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  29.76 
 
 		 469 aa  83.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.41 
 
 		 667 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2041  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  25.65 
 
 		 277 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  26.71 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  27.76 
 
 		 1062 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.65 
 
 		 720 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  27.96 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  29.23 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  34.08 
 
 		 1010 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1438  hypothetical protein  29.56 
 
 		 698 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466949  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  26.44 
 
 		 1071 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  25.31 
 
 		 656 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  28.76 
 
 		 685 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  30.32 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  35.43 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2847  WD40 domain-containing protein  28.2 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.0361789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>