More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0086 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0086  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
192 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.39 
 
 
197 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.91 
 
 
197 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  45.08 
 
 
194 aa  167  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.56 
 
 
194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.42 
 
 
195 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.52 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.69 
 
 
197 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.35 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.07 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.88 
 
 
201 aa  127  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.87 
 
 
201 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.96 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  41.01 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
214 aa  124  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  41.34 
 
 
197 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.74 
 
 
190 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.31 
 
 
197 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.25 
 
 
187 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.38 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.09 
 
 
199 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.9 
 
 
202 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.87 
 
 
196 aa  119  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.88 
 
 
203 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.27 
 
 
193 aa  117  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.36 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.31 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.63 
 
 
193 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1631  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.95 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.5 
 
 
201 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.5 
 
 
201 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  38 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0389  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.69 
 
 
200 aa  114  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174867  normal  0.0250824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.46 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.55 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.59 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0390  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.44 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.76 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.83 
 
 
204 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.21 
 
 
198 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1363  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.59 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 
200 aa  111  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 
200 aa  111  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.69 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.69 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.92 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.69 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.1 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2522  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000919135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0891  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0321  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.04 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.92 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.6 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.31 
 
 
193 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.95 
 
 
197 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  38.74 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.77 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.67 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 
200 aa  108  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.67 
 
 
202 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
202 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.01 
 
 
200 aa  108  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.46 
 
 
201 aa  108  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.89 
 
 
199 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1706  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.84 
 
 
193 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.08 
 
 
199 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.86 
 
 
192 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.8 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  35.47 
 
 
203 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.67 
 
 
202 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.73 
 
 
198 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.94 
 
 
192 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  35.47 
 
 
203 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.27 
 
 
193 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.6 
 
 
194 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.08 
 
 
199 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.87 
 
 
205 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  37.87 
 
 
202 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
203 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
203 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.92 
 
 
202 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
203 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
205 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
205 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
203 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
203 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
205 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
203 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
203 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
200 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.488567  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.82 
 
 
193 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  31.5 
 
 
203 aa  104  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.61 
 
 
209 aa  104  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0739  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.71 
 
 
190 aa  104  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0805847  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.62 
 
 
204 aa  104  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
205 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3953  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.89 
 
 
191 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0761943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>