More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0077 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 492 aa  1004    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 487 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 484 aa  472  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  45.71 
 
 		 495 aa  450  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 477 aa  439  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 490 aa  435  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 506 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 479 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 482 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 500 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 503 aa  415  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 495 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 509 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 486 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 488 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 489 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 463 aa  395  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 509 aa  398  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 501 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 481 aa  396  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 485 aa  395  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 467 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 490 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 491 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 473 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 504 aa  392  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 505 aa  385  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 480 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 471 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 471 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 471 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 471 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 471 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 471 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 491 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 506 aa  381  1e-104  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  40.96 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 493 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 472 aa  378  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 468 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 493 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 466 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 468 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 469 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 493 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 514 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 493 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 485 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>