More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0074 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0074  recA protein  100 
 
 		 344 aa  688    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  75.85 
 
 		 358 aa  523  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  69.21 
 
 		 351 aa  498  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  70.9 
 
 		 355 aa  484  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  68.9 
 
 		 341 aa  484  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  70.09 
 
 		 345 aa  478  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  67.35 
 
 		 366 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  68.1 
 
 		 343 aa  477  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  68.22 
 
 		 352 aa  471  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  68.22 
 
 		 352 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  67.49 
 
 		 365 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  68.39 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  64.97 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  67.29 
 
 		 378 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  67.17 
 
 		 343 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  67.81 
 
 		 341 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  67.88 
 
 		 347 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  68.85 
 
 		 347 aa  464  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  67.7 
 
 		 376 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2960  recombinase A  71.12 
 
 		 353 aa  461  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0334216  hitchhiker  0.0000660744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  67.91 
 
 		 350 aa  461  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  67.91 
 
 		 350 aa  461  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  67.7 
 
 		 359 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  67.91 
 
 		 350 aa  461  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  68.22 
 
 		 345 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  66.37 
 
 		 356 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  65.49 
 
 		 361 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  65.12 
 
 		 347 aa  461  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  66.15 
 
 		 360 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  66.57 
 
 		 355 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  67.08 
 
 		 336 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  68.22 
 
 		 350 aa  461  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  67.6 
 
 		 352 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1352  recA protein  66.67 
 
 		 337 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  67.18 
 
 		 361 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  66.67 
 
 		 345 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  65.55 
 
 		 348 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  65.85 
 
 		 357 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1488  recombination protein RecA  66.98 
 
 		 337 aa  458  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  67.7 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  65.27 
 
 		 347 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  67.18 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  65.27 
 
 		 347 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3118  recombinase A  71.12 
 
 		 353 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163831  unclonable  0.0000179844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  68.83 
 
 		 346 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  65.98 
 
 		 364 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  66.88 
 
 		 350 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  65.27 
 
 		 347 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  65.68 
 
 		 362 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  66.46 
 
 		 383 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  65.94 
 
 		 350 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_002936  DET1606  hypothetical protein  66.67 
 
 		 337 aa  457  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.533727  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  65.73 
 
 		 346 aa  455  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  66.98 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  65.22 
 
 		 348 aa  455  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  65.22 
 
 		 348 aa  454  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  65.54 
 
 		 338 aa  455  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  65.84 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  64.78 
 
 		 361 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  65.94 
 
 		 346 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  69.01 
 
 		 365 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  65.07 
 
 		 362 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  65.54 
 
 		 338 aa  455  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  66.97 
 
 		 357 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  65.07 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  68.35 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  67.82 
 
 		 360 aa  454  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  66.15 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  64.88 
 
 		 359 aa  455  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  66.04 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  65.42 
 
 		 379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  64.79 
 
 		 361 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  66.25 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  65.03 
 
 		 343 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  64.48 
 
 		 362 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  64.48 
 
 		 363 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  67.19 
 
 		 368 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  66.15 
 
 		 357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  65.11 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  66.36 
 
 		 390 aa  451  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  65.55 
 
 		 356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  65.42 
 
 		 358 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  62.8 
 
 		 362 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  64.6 
 
 		 351 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  63.58 
 
 		 364 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  64.18 
 
 		 363 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  67.69 
 
 		 333 aa  448  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  66.36 
 
 		 349 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  61.35 
 
 		 347 aa  448  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  66.67 
 
 		 349 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  65.74 
 
 		 347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  64.02 
 
 		 346 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  63.34 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  63.88 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  60.47 
 
 		 367 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  64.02 
 
 		 343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  62.09 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  64.8 
 
 		 358 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  63.86 
 
 		 352 aa  441  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  64.43 
 
 		 366 aa  441  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>