More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0061 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0061  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  100 
 
 
337 aa  664    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0983  rod shape-determining protein MreB  69.28 
 
 
336 aa  465  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.408355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1263  rod shape-determining protein MreB  67.76 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0510  rod shape-determining protein MreB  68.06 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.386132 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4074  rod shape-determining protein MreB  65.96 
 
 
333 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00041053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  60.66 
 
 
346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 
343 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61.26 
 
 
344 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  57.66 
 
 
340 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  58.21 
 
 
340 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  57.4 
 
 
345 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  58.26 
 
 
347 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  59.46 
 
 
347 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  57.44 
 
 
343 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  59.16 
 
 
347 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  58.68 
 
 
343 aa  388  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  59.04 
 
 
339 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 
343 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.75 
 
 
350 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  57.49 
 
 
347 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  57.53 
 
 
336 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  55.33 
 
 
346 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  58.66 
 
 
343 aa  386  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  58.68 
 
 
347 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  58.98 
 
 
344 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  58.68 
 
 
347 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  58.61 
 
 
345 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 
346 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  57.7 
 
 
344 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 
348 aa  381  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  55.92 
 
 
346 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  56.85 
 
 
343 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  57.66 
 
 
347 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  57.57 
 
 
339 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  54.73 
 
 
346 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  56.59 
 
 
347 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  57.31 
 
 
344 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  57.31 
 
 
344 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  58.1 
 
 
344 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
342 aa  375  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  57.96 
 
 
343 aa  378  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  56.84 
 
 
344 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  55.79 
 
 
368 aa  374  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 
344 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  54.33 
 
 
343 aa  371  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  56.72 
 
 
344 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  54.63 
 
 
346 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  56.4 
 
 
343 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  54.01 
 
 
347 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  56.18 
 
 
346 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 
344 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  53.8 
 
 
342 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  53.8 
 
 
342 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 
344 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 
340 aa  371  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  54.98 
 
 
339 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  56.72 
 
 
344 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  53.73 
 
 
343 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  57.06 
 
 
347 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  57.06 
 
 
347 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 
338 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  56.21 
 
 
342 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  56.46 
 
 
347 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  57.06 
 
 
347 aa  368  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  57.06 
 
 
347 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  55.56 
 
 
343 aa  368  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
347 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  57.06 
 
 
347 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 
339 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 
339 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 
339 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 
339 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  53.15 
 
 
342 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 
339 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 
339 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  57.06 
 
 
347 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 
339 aa  364  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 
339 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 
338 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  54.3 
 
 
346 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  56.16 
 
 
347 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 
339 aa  364  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  54.05 
 
 
344 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>