96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0032 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  100 
 
 
693 aa  1390    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  49.71 
 
 
672 aa  620  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  47.81 
 
 
614 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  47.49 
 
 
614 aa  555  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  47.2 
 
 
615 aa  534  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  44.22 
 
 
611 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  43.23 
 
 
627 aa  494  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  42.61 
 
 
612 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  40.27 
 
 
781 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  41.52 
 
 
608 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  41.52 
 
 
683 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  39.6 
 
 
611 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  41.27 
 
 
750 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  38.97 
 
 
609 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  38.97 
 
 
609 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  41.68 
 
 
668 aa  439  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  41.4 
 
 
653 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  39.66 
 
 
608 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  39.21 
 
 
731 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  39.69 
 
 
609 aa  436  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  40.09 
 
 
658 aa  435  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  39.35 
 
 
608 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  41.54 
 
 
674 aa  428  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  39.31 
 
 
654 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  39.97 
 
 
608 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  39.49 
 
 
655 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  40.59 
 
 
585 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  39.03 
 
 
664 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  37.54 
 
 
629 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  39.03 
 
 
664 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  39.03 
 
 
664 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  40.24 
 
 
681 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  37.98 
 
 
614 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  40.03 
 
 
691 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  38.44 
 
 
682 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  39.97 
 
 
608 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  38.66 
 
 
615 aa  411  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  39.06 
 
 
664 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  39.48 
 
 
696 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  38.05 
 
 
672 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  39.47 
 
 
608 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  37.62 
 
 
629 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  39.6 
 
 
608 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  37.67 
 
 
677 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  38.2 
 
 
636 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  39.2 
 
 
672 aa  405  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  38.63 
 
 
674 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  39.47 
 
 
608 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  39.32 
 
 
608 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  36.84 
 
 
627 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  38.85 
 
 
664 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  37.78 
 
 
685 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  38.07 
 
 
678 aa  395  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  39.94 
 
 
704 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  38.05 
 
 
667 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  39.81 
 
 
614 aa  388  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  38 
 
 
612 aa  389  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  39.3 
 
 
657 aa  389  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  39.41 
 
 
678 aa  382  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  37.94 
 
 
622 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  38.44 
 
 
677 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  38.53 
 
 
667 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  36.22 
 
 
615 aa  353  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  36.76 
 
 
619 aa  331  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  35.43 
 
 
647 aa  326  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  36.6 
 
 
777 aa  320  7.999999999999999e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  34.58 
 
 
774 aa  319  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.84 
 
 
815 aa  310  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  40.54 
 
 
365 aa  250  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  39.86 
 
 
470 aa  228  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  31.05 
 
 
650 aa  226  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  26.46 
 
 
685 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  38.06 
 
 
272 aa  167  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  27.18 
 
 
656 aa  165  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  26.85 
 
 
657 aa  163  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  26.91 
 
 
713 aa  159  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 
713 aa  159  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 
657 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  29.72 
 
 
680 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  25.52 
 
 
680 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  24.73 
 
 
647 aa  137  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  24.73 
 
 
647 aa  137  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  38.1 
 
 
253 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  34.32 
 
 
218 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  29.97 
 
 
657 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 
657 aa  97.1  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 
655 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  41.3 
 
 
101 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 
431 aa  54.7  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1104  amino acid transporter  25.94 
 
 
676 aa  53.9  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2156  amino acid transporters  26.99 
 
 
746 aa  52.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.739886  normal  0.876305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0162  amino acid transporter  24.48 
 
 
755 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  33.33 
 
 
448 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3899  hypothetical protein  33.33 
 
 
448 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.823757  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3914  hypothetical protein  33.33 
 
 
448 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2796  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 
580 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>