287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0025 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 
386 aa  776  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  45.53 
 
 
392 aa  307  2e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  44.23 
 
 
398 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  42.74 
 
 
394 aa  270  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  43.6 
 
 
385 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  37.26 
 
 
375 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  36.44 
 
 
373 aa  237  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  36.99 
 
 
375 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  36.99 
 
 
375 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  36.99 
 
 
375 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  36.99 
 
 
375 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.04808e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  36.99 
 
 
375 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  36.99 
 
 
375 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  36.99 
 
 
375 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  36.99 
 
 
375 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  36.99 
 
 
375 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  34.39 
 
 
374 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  36.36 
 
 
372 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  35.69 
 
 
374 aa  227  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.07 
 
 
360 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  35.04 
 
 
361 aa  219  9e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  35.04 
 
 
361 aa  219  9e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  37.27 
 
 
370 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  37.27 
 
 
370 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  34.23 
 
 
374 aa  218  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  34.57 
 
 
375 aa  212  8e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  34.76 
 
 
371 aa  211  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  34.87 
 
 
369 aa  210  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  34.33 
 
 
374 aa  210  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  35.13 
 
 
369 aa  207  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.91 
 
 
386 aa  206  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.15 
 
 
373 aa  202  9e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.08 
 
 
372 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  34.86 
 
 
366 aa  196  5e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.37 
 
 
376 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  34.44 
 
 
371 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  34.26 
 
 
390 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  3.32989e-05  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  35.23 
 
 
371 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  34.32 
 
 
359 aa  188  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  34.6 
 
 
365 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.12 
 
 
371 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  33.51 
 
 
365 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  33.06 
 
 
370 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.69508e-07  hitchhiker  1.45417e-07 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  31.17 
 
 
364 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  35.28 
 
 
376 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.1 
 
 
365 aa  179  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  34.6 
 
 
352 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  31.99 
 
 
370 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 
364 aa  174  2e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  33.96 
 
 
402 aa  173  4e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15476e-13 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  34.24 
 
 
384 aa  173  6e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.24 
 
 
360 aa  172  7e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  33.97 
 
 
401 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  32.46 
 
 
364 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.4 
 
 
363 aa  171  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  32.37 
 
 
368 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  34 
 
 
377 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.66 
 
 
362 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.15018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  34.33 
 
 
348 aa  167  3e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.18 
 
 
378 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  34.33 
 
 
348 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.05 
 
 
365 aa  165  2e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  30.75 
 
 
369 aa  164  2e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  34.92 
 
 
380 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  34.92 
 
 
380 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  34.32 
 
 
390 aa  163  4e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0003  RecF protein  30.26 
 
 
364 aa  163  5e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.056932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.88 
 
 
420 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.1529e-05  hitchhiker  4.44236e-07 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  34.5 
 
 
377 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.72 
 
 
363 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.42 
 
 
358 aa  159  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1620  recombination protein F  32.86 
 
 
358 aa  159  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  32.28 
 
 
414 aa  159  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  32.28 
 
 
362 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.58 
 
 
370 aa  156  5e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  31.9 
 
 
404 aa  156  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0394  recombination protein F  33.97 
 
 
364 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  32.95 
 
 
371 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.08 
 
 
382 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  33.15 
 
 
376 aa  152  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  1.32668e-05 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.15 
 
 
397 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.21 
 
 
359 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.65 
 
 
374 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  32.67 
 
 
363 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  34.44 
 
 
377 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.17 
 
 
381 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.03 
 
 
397 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  31.68 
 
 
390 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.74 
 
 
369 aa  149  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  32 
 
 
401 aa  149  1e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.42 
 
 
398 aa  148  1e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  29.69 
 
 
390 aa  149  1e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.05 
 
 
399 aa  149  1e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.82 
 
 
379 aa  147  2e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  29.83 
 
 
385 aa  145  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  30.66 
 
 
380 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  30.26 
 
 
389 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  30.81 
 
 
371 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  32.79 
 
 
387 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  33.62 
 
 
377 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>