162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0020 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  100 
 
 
359 aa  734    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  36.21 
 
 
362 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  37.89 
 
 
368 aa  195  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  33.7 
 
 
379 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  29.89 
 
 
430 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  35.6 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  34.55 
 
 
352 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  35.71 
 
 
350 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  32.28 
 
 
357 aa  96.3  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  30.89 
 
 
360 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  32.95 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  36.05 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  30 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  35.92 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  28.5 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  25.1 
 
 
375 aa  67  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  33.56 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  35.82 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  32.35 
 
 
318 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15560  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  28.27 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  30.34 
 
 
334 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  29.07 
 
 
379 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  27.89 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  27.5 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  24.12 
 
 
377 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  29.66 
 
 
367 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  32.7 
 
 
304 aa  60.1  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  28.57 
 
 
350 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  23.84 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  24.36 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1302  putative RNA methylase  30.39 
 
 
510 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  26.49 
 
 
317 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  22.17 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  32.17 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  31.91 
 
 
333 aa  56.6  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  26.53 
 
 
379 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  26.53 
 
 
379 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  22.17 
 
 
375 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  25 
 
 
356 aa  56.2  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  33.12 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  28.65 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  26.12 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  26.12 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  26.12 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  26.12 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  26.12 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  26.12 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  26.12 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  27.72 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.79 
 
 
713 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  25 
 
 
381 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  25 
 
 
381 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4151  putative RNA methylase  29.52 
 
 
398 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.949301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  27.05 
 
 
384 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  27.89 
 
 
310 aa  53.5  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.67 
 
 
258 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  26.02 
 
 
379 aa  53.1  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  24.9 
 
 
379 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0218  putative RNA methylase  29.8 
 
 
348 aa  52.8  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547055 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  30.43 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  25.26 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  29.86 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  27.33 
 
 
315 aa  52.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  50 
 
 
384 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  32.74 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  26.51 
 
 
371 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  32.24 
 
 
329 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  50 
 
 
380 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  27.38 
 
 
376 aa  50.1  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  24.68 
 
 
377 aa  50.1  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  26.15 
 
 
393 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  29.24 
 
 
398 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  27.27 
 
 
378 aa  49.7  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  27.52 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.42 
 
 
706 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2178  methyltransferase small  31.09 
 
 
390 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.42 
 
 
706 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.42 
 
 
706 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  26.29 
 
 
391 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  26.83 
 
 
475 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0499  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.4 
 
 
734 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.639423  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  27.72 
 
 
399 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  30.4 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  26.75 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 
313 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  27.33 
 
 
389 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  28.26 
 
 
341 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
305 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  30 
 
 
239 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
254 aa  47  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2035  putative RNA methylase  24.5 
 
 
395 aa  46.6  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000306959  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  29.55 
 
 
341 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  24.59 
 
 
380 aa  46.6  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  27.5 
 
 
484 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.53 
 
 
705 aa  46.2  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  21.57 
 
 
730 aa  46.2  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.11 
 
 
749 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>