More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0008 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0008  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 159 aa  307  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  52.53 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  50.66 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  50.65 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  46.25 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  43.48 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 163 aa  123  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  41.25 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  46.58 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  41.25 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  40.62 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  40.62 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  40.62 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  40.62 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  40.62 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  41.88 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  45 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  48.53 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  41.25 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  40.37 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  41.25 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 168 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  38.75 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  43.04 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  47.22 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  43.05 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  41.06 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  40.79 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  41.14 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  39.74 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  40.74 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  39.87 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  42.24 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  39.62 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  42.33 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  42.33 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  41.1 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  41.14 
 
 		 172 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  42.33 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  41.1 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>