More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0007 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 497 aa  1008    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  58.52 
 
 		 489 aa  561  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 489 aa  553  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 510 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  53.91 
 
 		 488 aa  541  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 489 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 		 496 aa  538  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 		 489 aa  535  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 493 aa  538  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 491 aa  535  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 497 aa  530  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 494 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 494 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 490 aa  528  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 499 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 499 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 495 aa  509  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 499 aa  508  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 515 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 561 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 501 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 501 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 515 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 495 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 504 aa  500  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 492 aa  499  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 499 aa  495  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 573 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 573 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 499 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 573 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 499 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 499 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.2 
 
 		 498 aa  491  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 499 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  490  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 489 aa  491  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 498 aa  488  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 499 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  50.2 
 
 		 491 aa  485  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 503 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 508 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 509 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1681  lysyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 491 aa  482  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 498 aa  479  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 491 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 523 aa  481  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 494 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 492 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 503 aa  476  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 647 aa  475  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 502 aa  473  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 631 aa  473  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 502 aa  473  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 502 aa  473  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 503 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 505 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 492 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 514 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 524 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 512 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 508 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 508 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 508 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 492 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 508 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 508 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 508 aa  465  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 506 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 506 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 502 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1472  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 514 aa  460  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 502 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 508 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 503 aa  461  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 512 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 510 aa  455  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  47.96 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 532 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 515 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 502 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>