More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0001 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
456 aa  938  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  53.32 
 
 
472 aa  506  1e-142  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  51.15 
 
 
481 aa  494  1e-138  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.6365e-07  unclonable  1.12062e-05 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  50.63 
 
 
480 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  6.50471e-10 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  50.85 
 
 
478 aa  469  1e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  50.11 
 
 
442 aa  448  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.81 
 
 
453 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  48.01 
 
 
446 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  48.01 
 
 
446 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  48.01 
 
 
446 aa  435  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  48.01 
 
 
446 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  48.23 
 
 
450 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  48.46 
 
 
450 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  48.01 
 
 
446 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  47.79 
 
 
446 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.89 
 
 
449 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  47.79 
 
 
446 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  48.55 
 
 
440 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  47.58 
 
 
446 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  46.9 
 
 
446 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  49.44 
 
 
441 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  47.58 
 
 
446 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  46.68 
 
 
446 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.96 
 
 
454 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  46.83 
 
 
451 aa  421  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  44.4 
 
 
457 aa  417  1e-115  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  44.18 
 
 
457 aa  416  1e-115  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.77 
 
 
444 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  47.22 
 
 
443 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.01 
 
 
439 aa  412  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.02 
 
 
446 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  44.89 
 
 
443 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  44.23 
 
 
453 aa  401  1e-110  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  44.23 
 
 
453 aa  401  1e-110  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  46.26 
 
 
436 aa  400  1e-110  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.38 
 
 
463 aa  401  1e-110  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.58 
 
 
443 aa  401  1e-110  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.3 
 
 
439 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  1.09214e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  46.55 
 
 
460 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  45.86 
 
 
460 aa  388  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  47.95 
 
 
445 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.6 
 
 
458 aa  386  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  46.59 
 
 
470 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  46.21 
 
 
453 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  46.21 
 
 
453 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  45.15 
 
 
456 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  43.74 
 
 
482 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  44.59 
 
 
452 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.56 
 
 
453 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.67 
 
 
480 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45 
 
 
454 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  44.81 
 
 
494 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  42.64 
 
 
458 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  45.66 
 
 
440 aa  375  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  45.77 
 
 
495 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  45.77 
 
 
495 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  42.24 
 
 
460 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  45.77 
 
 
495 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  44.56 
 
 
492 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  41.47 
 
 
449 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  42 
 
 
445 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  44.44 
 
 
453 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.33 
 
 
447 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.68 
 
 
509 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.07 
 
 
476 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  2.40109e-09  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.38 
 
 
591 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.21 
 
 
587 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.37 
 
 
450 aa  364  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  42 
 
 
450 aa  364  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  42.09 
 
 
454 aa  362  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  43.89 
 
 
462 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.89 
 
 
528 aa  358  2e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.33 
 
 
461 aa  357  3e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  43.51 
 
 
462 aa  357  3e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.81438e-07  unclonable  1.18337e-08 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.1 
 
 
475 aa  356  4e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  42.44 
 
 
461 aa  355  8e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.1e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.36 
 
 
503 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  41.69 
 
 
459 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.86226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  44.49 
 
 
466 aa  353  3e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.23 
 
 
489 aa  353  3e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  41.14 
 
 
460 aa  353  3e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.24276e-06  unclonable  1.76e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  41.56 
 
 
462 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.57358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  42.09 
 
 
460 aa  353  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  41.56 
 
 
462 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.98931e-09  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  41.56 
 
 
462 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.62887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  41.56 
 
 
462 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.57699e-06  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  42.09 
 
 
460 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.79736e-07  unclonable  3.13535e-11 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  42.09 
 
 
460 aa  353  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81375e-07  unclonable  6.00935e-11 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  41.48 
 
 
461 aa  352  8e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.63579e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  41.78 
 
 
459 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  7.81636e-06  unclonable  3.44978e-06 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.93 
 
 
506 aa  352  1e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  44.08 
 
 
464 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.27 
 
 
445 aa  351  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  41.76 
 
 
462 aa  351  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.11976e-10  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  41.79 
 
 
461 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.02323e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0973  chromosomal replication initiation protein  43.9 
 
 
450 aa  350  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.03 
 
 
721 aa  351  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  4.23182e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.87 
 
 
473 aa  350  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.84064e-14 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  41.78 
 
 
452 aa  349  5e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  41.78 
 
 
452 aa  349  5e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>