More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_R0041 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_R0041  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0038  tRNA-Val  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.978426  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0042  tRNA-Val  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000949792  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0062  tRNA-Val  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0206433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0045  tRNA-Val  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00029215  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0053  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000170226  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0701  tRNA-Val  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0039  tRNA-Val  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0044  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10340  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0379292 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0017  tRNA-Val  97.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00877292  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0044  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0031  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0043  tRNA-Val  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.174816  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0043  tRNA-Val  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000221825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0063  tRNA-Val  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0011  tRNA-Val  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000197558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0069  tRNA-Val  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0015  tRNA-Val  92.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0605809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309272  tRNA-Val  92.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0013  tRNA-Val  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0072  tRNA-Val  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0027  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0045  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309362  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0031  tRNA-Val  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.03601e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0078  tRNA-Val  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0025  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0003  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0011  tRNA-Val  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0051  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000148873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0046  tRNA-Val  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0052  tRNA-Val  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.599035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0041  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.576244  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAValVIMSS1309068  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309119  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.255702  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309186  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.8123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0022  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520763  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAValVIMSS1309144  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0213338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0072  tRNA-Val  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0089  tRNA-Val  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000177778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0090  tRNA-Val  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000163432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0039  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0033  tRNA-Ala  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0040  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000841644  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0709  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0020  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0035  tRNA-Val  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0133528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5650  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000315313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5674  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000774972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5687  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000478099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-2  tRNA-Val  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-3  tRNA-Val  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-5  tRNA-Val  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000098013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-6  tRNA-Val  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000153225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-1  tRNA-Val  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0417532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-3  tRNA-Val  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000052933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-4  tRNA-Val  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00757095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-7  tRNA-Val  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000452768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-1  tRNA-Val  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000230232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-2  tRNA-Val  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-3  tRNA-Val  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000779763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-5  tRNA-Val  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000106447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-6  tRNA-Val  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000215711  hitchhiker  0.00721353 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-1  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-2  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000053562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-3  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-4  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-6  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778849  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0058  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.703111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0294  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000261183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5666  tRNA-Val  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000870426  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0043  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00024501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5819  tRNA-Val  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000675228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5725  tRNA-Val  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5050  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000188833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4774  tRNA-Val  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000014475  hitchhiker  6.83474e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4578  tRNA-Val  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000592849  normal  0.0827232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0170  tRNA-Val  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0237549 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0272  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5145  tRNA-Val  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000184879  normal  0.692523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0212  tRNA-Val  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000868799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5709  tRNA-Val  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000949158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0025  tRNA-Val  83.82 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0239971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0045  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0036  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0143  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000199332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0097  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000152963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0191  tRNA-Val  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000034986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5034  tRNA-Val  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000220203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0603  tRNA-Val  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000989267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0095  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0080  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000518886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5653  tRNA-Val  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000741856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>