175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1759 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 		 332 aa  648    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.34 
 
 		 330 aa  328  7e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  34.22 
 
 		 352 aa  185  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  33.33 
 
 		 352 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  33.33 
 
 		 352 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.62 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  33.33 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  33.04 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  35.94 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  35.94 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  32.02 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 334 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  33.62 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  34.59 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  31.61 
 
 		 375 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  30.79 
 
 		 385 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  29.45 
 
 		 359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  26.74 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  29.94 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.09 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.49 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.06 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  29 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.4 
 
 		 373 aa  96.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  28.57 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4152  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.87 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0839918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.42 
 
 		 354 aa  89.7  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  25.83 
 
 		 357 aa  89.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.55 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.43 
 
 		 371 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  28.49 
 
 		 371 aa  86.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.26 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.73 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.02 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.68 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  43.3 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  25.87 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  22.7 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0777  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.67 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226768  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  37.96 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  26.93 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  45 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  36.61 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  36.61 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  36.61 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  36.61 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  36.61 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  36.61 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  36.61 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.04 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1252  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480893  normal  0.396989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  26.38 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2704  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1710  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  37.96 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2164  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1059  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000178842  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.69 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2029  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.89 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4263  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.96 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409839  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.28 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  28.25 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  36.11 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.07 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  26.98 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  24.41 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4250  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.61 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.778498  normal  0.233136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4955  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.07 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  39.81 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.6 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4366  hypothetical protein  27.05 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  27.59 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.88 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.5 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.59 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  36.89 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0829  putative inner membrane protein  36.54 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  36.89 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  24.31 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.11 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  35 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1528  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.44 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  35.92 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.49 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.14 
 
 		 180 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3665  YeeE/YedE family membrane protein  26.44 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3126  YeeE/YedE  23.79 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.23 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  27.27 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>