More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1694 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
332 aa  663    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  94.58 
 
 
332 aa  636    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  45.45 
 
 
339 aa  320  3e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  41.44 
 
 
346 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  40 
 
 
330 aa  243  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  38.23 
 
 
334 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  38.23 
 
 
334 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  38.23 
 
 
330 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  37.92 
 
 
330 aa  225  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  38.23 
 
 
330 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  37.61 
 
 
330 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  36.83 
 
 
337 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  37.08 
 
 
350 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  35.24 
 
 
355 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  34.8 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  35.95 
 
 
332 aa  208  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  35.35 
 
 
350 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  34.04 
 
 
354 aa  206  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  35.22 
 
 
356 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  35.53 
 
 
356 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  32.63 
 
 
350 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  35.26 
 
 
325 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  37.22 
 
 
331 aa  202  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  35.17 
 
 
333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  32.12 
 
 
351 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  34.28 
 
 
338 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  32.22 
 
 
350 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  32.22 
 
 
350 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  33.12 
 
 
346 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  33.54 
 
 
355 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  33.03 
 
 
351 aa  192  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  33.87 
 
 
371 aa  192  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  33.43 
 
 
337 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  34.38 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  32.43 
 
 
335 aa  188  9e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  32.23 
 
 
335 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  32.23 
 
 
362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  32.92 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  30.99 
 
 
336 aa  181  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  33.54 
 
 
346 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29.7 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  29.79 
 
 
335 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.48 
 
 
335 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  32.63 
 
 
337 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  37.82 
 
 
341 aa  175  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  33.12 
 
 
352 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  30.98 
 
 
352 aa  170  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  32 
 
 
341 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  30.91 
 
 
352 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  32.12 
 
 
384 aa  169  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.79 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  31.12 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  28.35 
 
 
351 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  28.35 
 
 
351 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  29.75 
 
 
351 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  28.35 
 
 
351 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  30.84 
 
 
357 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  31.17 
 
 
351 aa  156  4e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  29.88 
 
 
346 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  29.88 
 
 
346 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  32.67 
 
 
345 aa  149  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 
509 aa  146  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  31.85 
 
 
347 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  29.74 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  29.85 
 
 
368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  29.02 
 
 
366 aa  129  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  30.4 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  38.86 
 
 
182 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  27.19 
 
 
531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 
668 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 
693 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  39.42 
 
 
146 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  26.91 
 
 
652 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  24.47 
 
 
376 aa  104  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  32.59 
 
 
225 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 
771 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 
665 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  28.91 
 
 
544 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  26.52 
 
 
378 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  29.31 
 
 
388 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  25 
 
 
335 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.52 
 
 
395 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  28.18 
 
 
567 aa  99.8  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  27.24 
 
 
673 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 
544 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  28.38 
 
 
671 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 
773 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  30.42 
 
 
542 aa  97.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  32.07 
 
 
395 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  28.74 
 
 
775 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  28.51 
 
 
674 aa  95.9  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  27.95 
 
 
366 aa  95.9  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  29.68 
 
 
402 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  29.95 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  29.95 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.24 
 
 
671 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  29.95 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  29.95 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  29.68 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>