56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1691 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  98.2 
 
 		 444 aa  869    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  100 
 
 		 445 aa  887    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 402 aa  127  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 531 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 504 aa  106  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  26.84 
 
 		 440 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 513 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  22.62 
 
 		 457 aa  94  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  25 
 
 		 461 aa  93.2  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  26.37 
 
 		 490 aa  86.7  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  26.81 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  24.24 
 
 		 468 aa  79.7  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  22.89 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  25.96 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  22.89 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  27.03 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  21.07 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  25.91 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  21.12 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 454 aa  67  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 387 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  21.96 
 
 		 413 aa  43.5  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 467 aa  43.1  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>