More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1644 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  100 
 
 
197 aa  388  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  91.88 
 
 
197 aa  363  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  55.21 
 
 
197 aa  197  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  52.31 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  46.19 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  47.96 
 
 
207 aa  171  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  43.52 
 
 
222 aa  171  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  47.29 
 
 
207 aa  170  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  49.5 
 
 
220 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  47.42 
 
 
217 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  51.09 
 
 
207 aa  168  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  45.5 
 
 
214 aa  168  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  42.45 
 
 
212 aa  168  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  45.45 
 
 
223 aa  166  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  46.12 
 
 
217 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  48.24 
 
 
204 aa  165  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  46.67 
 
 
211 aa  165  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  46.31 
 
 
207 aa  165  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  46.53 
 
 
224 aa  164  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  43.48 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  45.69 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  45.6 
 
 
213 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  43.84 
 
 
216 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  50.25 
 
 
202 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  47.26 
 
 
207 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.33 
 
 
219 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  41.92 
 
 
207 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  44.44 
 
 
688 aa  158  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  45.37 
 
 
215 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  45.69 
 
 
213 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  42.65 
 
 
211 aa  154  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  42.57 
 
 
210 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  43.48 
 
 
216 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  43.65 
 
 
213 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  45.08 
 
 
218 aa  151  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  44.74 
 
 
217 aa  151  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  43.46 
 
 
229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  43.88 
 
 
205 aa  150  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  41.04 
 
 
219 aa  150  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  47.62 
 
 
202 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  43.75 
 
 
215 aa  149  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  41.67 
 
 
204 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  41.83 
 
 
225 aa  149  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.78 
 
 
206 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  45.6 
 
 
662 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  44.62 
 
 
205 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  44.92 
 
 
221 aa  149  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  43.66 
 
 
226 aa  148  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  40.87 
 
 
217 aa  148  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  44.56 
 
 
222 aa  148  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  43.68 
 
 
224 aa  148  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  42.03 
 
 
214 aa  147  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  41.92 
 
 
216 aa  147  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  44 
 
 
705 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  43.07 
 
 
901 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  43.81 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  43.52 
 
 
211 aa  145  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  42.44 
 
 
214 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  44.33 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  42.41 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  41.15 
 
 
219 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  42.5 
 
 
281 aa  144  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  43 
 
 
703 aa  144  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  37.8 
 
 
215 aa  144  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  42.29 
 
 
212 aa  144  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  47.06 
 
 
206 aa  143  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  41.23 
 
 
217 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  43.81 
 
 
207 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  40.3 
 
 
208 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  40.1 
 
 
209 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  41.24 
 
 
209 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  40.3 
 
 
208 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  42.71 
 
 
671 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  42.93 
 
 
200 aa  142  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  40.7 
 
 
208 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  42.78 
 
 
210 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  42.05 
 
 
234 aa  142  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  40.3 
 
 
208 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  41.79 
 
 
202 aa  141  6e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  41.88 
 
 
203 aa  141  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  43.46 
 
 
226 aa  141  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  39.3 
 
 
208 aa  141  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  39.3 
 
 
208 aa  141  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  39.3 
 
 
208 aa  141  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  39.3 
 
 
208 aa  141  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  39.3 
 
 
208 aa  141  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  43.22 
 
 
686 aa  141  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  42.51 
 
 
209 aa  141  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  39.3 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  37.22 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  39.3 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  43.46 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  40.98 
 
 
221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  40.31 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.38 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  42.93 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  41.12 
 
 
215 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  39.81 
 
 
218 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  40.31 
 
 
206 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  37.02 
 
 
211 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>