190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1642 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  100 
 
 
187 aa  380  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  88.24 
 
 
187 aa  345  2e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  52.17 
 
 
184 aa  190  8e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  47.65 
 
 
196 aa  165  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  43.92 
 
 
181 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  43.79 
 
 
185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  39.57 
 
 
186 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  40.48 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.48 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  40.48 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  40.48 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  40.48 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  40.48 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  40.48 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  40.48 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  40.48 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  39.64 
 
 
183 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  41.07 
 
 
183 aa  124  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  40.36 
 
 
183 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  42.47 
 
 
188 aa  124  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  40.24 
 
 
183 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  38.69 
 
 
183 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  38.69 
 
 
183 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  38.69 
 
 
183 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  38.69 
 
 
183 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  38.69 
 
 
183 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  40.48 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.22 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  37.23 
 
 
189 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  38.83 
 
 
183 aa  117  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  37.35 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  37.35 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  37.35 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  40.72 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  38.76 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  34.57 
 
 
181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  34.59 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  33.51 
 
 
181 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  37.97 
 
 
188 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  34.5 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.59 
 
 
182 aa  108  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.76 
 
 
186 aa  108  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  34.78 
 
 
187 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  32.28 
 
 
187 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  40 
 
 
178 aa  100  9e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.52 
 
 
187 aa  98.6  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  39.38 
 
 
174 aa  98.2  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  32.09 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  36.69 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.93 
 
 
186 aa  87.8  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  28.49 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.81 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  30.67 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.95 
 
 
162 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.06 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  32.43 
 
 
166 aa  70.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.86 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  28.82 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.65 
 
 
154 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  27.13 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.86 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.47 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.86 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.59 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  27.27 
 
 
219 aa  62.4  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  28.24 
 
 
162 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.42 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  25.13 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0846  metallophosphoesterase  26.05 
 
 
244 aa  59.3  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.537551  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  32.16 
 
 
148 aa  59.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  30.38 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  28.9 
 
 
157 aa  58.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  24.87 
 
 
167 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  31.68 
 
 
174 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2607  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
244 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.783934 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  24.61 
 
 
167 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  24.61 
 
 
167 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  24.61 
 
 
167 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  24.87 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  24.61 
 
 
167 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  24.08 
 
 
167 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  24.08 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  24.35 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25 
 
 
227 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.98 
 
 
165 aa  55.1  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1812  metallophosphoesterase  24.18 
 
 
244 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.04 
 
 
163 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  27.44 
 
 
169 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.35 
 
 
181 aa  54.3  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0201  metallophosphoesterase  29 
 
 
264 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  27.01 
 
 
259 aa  54.3  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.16 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  24.24 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0139  metallophosphoesterase  28.14 
 
 
260 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.18757  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  24.52 
 
 
233 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  25.84 
 
 
167 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  25.84 
 
 
167 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.27 
 
 
156 aa  51.6  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  27.23 
 
 
259 aa  51.6  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>