More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1588 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  93.5 
 
 
446 aa  826    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  100 
 
 
446 aa  887    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  55.28 
 
 
447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  50.22 
 
 
447 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  49.77 
 
 
449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  42.66 
 
 
449 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  41.4 
 
 
443 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  42.28 
 
 
452 aa  348  1e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  40.05 
 
 
444 aa  343  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  38.83 
 
 
468 aa  340  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  39.64 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  39.87 
 
 
463 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  38.46 
 
 
465 aa  335  7.999999999999999e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  36.65 
 
 
466 aa  332  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  37.92 
 
 
463 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  37.1 
 
 
462 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  37.1 
 
 
462 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  38.17 
 
 
460 aa  322  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  37.61 
 
 
468 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  37.39 
 
 
468 aa  319  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  36.94 
 
 
469 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  36.94 
 
 
468 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  36.22 
 
 
469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  36.22 
 
 
469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  37.92 
 
 
454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  37.28 
 
 
460 aa  305  9.000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  34.68 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  37.72 
 
 
460 aa  301  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  35.39 
 
 
444 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  36.38 
 
 
460 aa  300  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  37.76 
 
 
450 aa  299  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  37.58 
 
 
460 aa  299  8e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  36.78 
 
 
486 aa  298  1e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  37.72 
 
 
460 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  36.52 
 
 
454 aa  298  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  36.81 
 
 
458 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  36.22 
 
 
449 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  38.41 
 
 
453 aa  295  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  34.23 
 
 
465 aa  293  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  36.32 
 
 
486 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  36.07 
 
 
463 aa  287  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  37.36 
 
 
460 aa  286  5e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  37.82 
 
 
473 aa  286  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  32.95 
 
 
447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  36.66 
 
 
442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  37.59 
 
 
471 aa  282  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  37.64 
 
 
462 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  35.33 
 
 
461 aa  279  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  34.53 
 
 
460 aa  276  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  35.9 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  32.8 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  35.31 
 
 
458 aa  274  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1068  magnesium transporter  34.19 
 
 
441 aa  272  7e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3240  magnesium transporter  34.4 
 
 
451 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0666949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  36.78 
 
 
454 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  36.24 
 
 
449 aa  266  5.999999999999999e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  31.89 
 
 
450 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  35.06 
 
 
458 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3406  magnesium transporter  34.4 
 
 
447 aa  262  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200177  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3316  magnesium transporter  35.68 
 
 
473 aa  259  7e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.685446  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  34.15 
 
 
451 aa  258  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  33.48 
 
 
454 aa  256  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  36.78 
 
 
441 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  32.4 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  36.54 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  36.54 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  33.41 
 
 
450 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  36.71 
 
 
454 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4176  magnesium transporter  33.81 
 
 
452 aa  253  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.987951  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  31.95 
 
 
456 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  32.32 
 
 
447 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  31.89 
 
 
451 aa  250  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  32.26 
 
 
455 aa  250  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  33.73 
 
 
461 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  32.85 
 
 
452 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  33.73 
 
 
461 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  32.05 
 
 
454 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33110  Mg2+ transporter MgtE  36.41 
 
 
446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237395  normal  0.754036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  32.41 
 
 
456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1907  magnesium transporter  32.29 
 
 
445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  31.62 
 
 
452 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2187  magnesium transporter  31.03 
 
 
461 aa  243  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183067  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  33.41 
 
 
454 aa  243  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04510  Mg2+ transporter MgtE  31.31 
 
 
450 aa  242  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  31.81 
 
 
445 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3299  magnesium transporter  33.03 
 
 
450 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000163374  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  36.46 
 
 
438 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  34.79 
 
 
461 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  33.03 
 
 
447 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  31.11 
 
 
454 aa  239  8e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  31.36 
 
 
456 aa  239  9e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  35.45 
 
 
454 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  31.89 
 
 
482 aa  236  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  32.27 
 
 
454 aa  236  8e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0507  hypothetical protein  29.61 
 
 
463 aa  234  3e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.593937 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  33.33 
 
 
451 aa  234  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  31.84 
 
 
458 aa  234  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  32.27 
 
 
457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  32.02 
 
 
457 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  31.16 
 
 
465 aa  229  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>