194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1486 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  80.84 
 
 		 694 aa  1157    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  100 
 
 		 694 aa  1393    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  42.86 
 
 		 692 aa  551  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  34.4 
 
 		 727 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  24.7 
 
 		 674 aa  171  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  24.22 
 
 		 674 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.78 
 
 		 764 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  23.38 
 
 		 689 aa  129  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  22.75 
 
 		 669 aa  112  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  22.99 
 
 		 767 aa  106  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  25.34 
 
 		 755 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.95 
 
 		 807 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  32.29 
 
 		 898 aa  93.2  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  23.48 
 
 		 835 aa  93.2  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  23.85 
 
 		 807 aa  90.1  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  21.05 
 
 		 828 aa  89.7  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.13 
 
 		 1051 aa  87.8  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  23.7 
 
 		 815 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  23.92 
 
 		 806 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  23.12 
 
 		 789 aa  84.7  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  22.43 
 
 		 756 aa  84  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  22.46 
 
 		 805 aa  82.8  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  24.43 
 
 		 813 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  22.37 
 
 		 816 aa  81.3  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  21.5 
 
 		 821 aa  81.3  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  18.77 
 
 		 825 aa  80.9  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  27.02 
 
 		 778 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  30.98 
 
 		 905 aa  78.2  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  21.87 
 
 		 895 aa  78.2  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  22.39 
 
 		 815 aa  77  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.14 
 
 		 837 aa  76.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  21.66 
 
 		 864 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  19.21 
 
 		 799 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  19.78 
 
 		 821 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  21.49 
 
 		 787 aa  71.2  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  19.44 
 
 		 794 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  19.26 
 
 		 799 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  20.68 
 
 		 799 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.36 
 
 		 861 aa  70.1  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  20.19 
 
 		 799 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  21.55 
 
 		 751 aa  69.7  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.95 
 
 		 811 aa  68.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  23.57 
 
 		 788 aa  68.9  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  24.14 
 
 		 788 aa  67.4  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.98 
 
 		 747 aa  67.4  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  23.61 
 
 		 869 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  21.55 
 
 		 800 aa  67.4  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  32.87 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  23.14 
 
 		 789 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  25.15 
 
 		 763 aa  65.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  20.99 
 
 		 831 aa  66.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  20.34 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  19.92 
 
 		 788 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  19.84 
 
 		 808 aa  65.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.29 
 
 		 798 aa  65.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  30.91 
 
 		 872 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  21.32 
 
 		 792 aa  65.1  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.11 
 
 		 800 aa  64.7  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  22.74 
 
 		 881 aa  64.7  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  30.68 
 
 		 874 aa  64.7  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  22.9 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  28.06 
 
 		 387 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  22.49 
 
 		 385 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  21.73 
 
 		 834 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  22.75 
 
 		 823 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.25 
 
 		 831 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  23.87 
 
 		 788 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  26.32 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  20.04 
 
 		 799 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  23.01 
 
 		 685 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  21.39 
 
 		 792 aa  62.4  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  26.83 
 
 		 845 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.21 
 
 		 762 aa  62  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  22.69 
 
 		 823 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  26.24 
 
 		 1204 aa  61.6  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  20.87 
 
 		 748 aa  61.6  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  29.07 
 
 		 862 aa  61.6  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  22.17 
 
 		 803 aa  61.6  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  24.78 
 
 		 849 aa  61.2  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  24.14 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  20.1 
 
 		 816 aa  60.8  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  19.53 
 
 		 796 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  20 
 
 		 786 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  20 
 
 		 786 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.3 
 
 		 1172 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.78 
 
 		 1226 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  28.68 
 
 		 746 aa  59.7  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  22.83 
 
 		 797 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  22.32 
 
 		 823 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  20 
 
 		 786 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  22.45 
 
 		 860 aa  60.1  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  21.56 
 
 		 1359 aa  59.3  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  18.21 
 
 		 784 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  26.49 
 
 		 790 aa  58.9  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  19.51 
 
 		 790 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  19.49 
 
 		 778 aa  58.9  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  26.73 
 
 		 859 aa  57.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  20.89 
 
 		 877 aa  57.8  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  18.68 
 
 		 796 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  19.32 
 
 		 793 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>