32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1355 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1355  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  519  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000306727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1331  uncharacterized protein-like protein  92.83 
 
 
251 aa  486  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236749  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  45.95 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  45.11 
 
 
263 aa  193  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0589  uncharacterized protein-like protein  28.86 
 
 
256 aa  92.4  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  27.02 
 
 
452 aa  85.5  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  27.69 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0802  hypothetical protein  31.11 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  29.19 
 
 
731 aa  82  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  25.37 
 
 
413 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1046  hypothetical protein  29.44 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  26.15 
 
 
387 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  26.15 
 
 
387 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0430  hypothetical protein  33.11 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000822296  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  25 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  28.65 
 
 
416 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2326  hypothetical protein  31.43 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0823  hypothetical protein  31.75 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1914  hypothetical protein  29.73 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000181439  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0098  hypothetical protein  33.07 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.888213  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  31.69 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0398  hypothetical protein  25.41 
 
 
363 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0205741  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  22.65 
 
 
365 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  25.32 
 
 
1035 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  28.57 
 
 
903 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16010  hypothetical protein  23.56 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1967  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  29.36 
 
 
862 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.543569  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3087  hypothetical protein  26.92 
 
 
450 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  22.1 
 
 
366 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00861  hypothetical protein  22.35 
 
 
361 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1373  hypothetical protein  24.64 
 
 
320 aa  43.5  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0077  hypothetical protein  20.8 
 
 
366 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>