More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1336 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1336  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
104 aa  205  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  99.04 
 
 
104 aa  204  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  55.24 
 
 
106 aa  121  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0805  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 
104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0438  50S ribosomal protein L21  55.24 
 
 
106 aa  101  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000719851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
104 aa  100  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  48.04 
 
 
103 aa  100  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  53.33 
 
 
102 aa  97.4  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  46.15 
 
 
105 aa  97.1  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  44.66 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  45.1 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
114 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  45.1 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
102 aa  94  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  93.6  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  93.6  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1113  ribosomal protein L21  50.96 
 
 
118 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.582987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  44.23 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  92  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
104 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  46.6 
 
 
132 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  44.23 
 
 
104 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
104 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
104 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  46.15 
 
 
103 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
102 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  88.2  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 
103 aa  88.2  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 
105 aa  87.8  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  87.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  46.53 
 
 
100 aa  87.4  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
102 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  38.83 
 
 
103 aa  87  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  87  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  87  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  47.06 
 
 
149 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  45.19 
 
 
102 aa  85.9  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  45.54 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0412  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 
103 aa  84  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>