More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1306 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  82.09 
 
 
134 aa  233  6e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  79.85 
 
 
134 aa  219  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  72.39 
 
 
134 aa  205  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  66.42 
 
 
132 aa  180  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  65.67 
 
 
134 aa  179  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  64.18 
 
 
132 aa  178  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  65.67 
 
 
132 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  63.43 
 
 
132 aa  176  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  63.43 
 
 
132 aa  176  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  63.43 
 
 
132 aa  176  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  63.43 
 
 
132 aa  176  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  63.43 
 
 
132 aa  176  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  63.43 
 
 
132 aa  176  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  63.43 
 
 
132 aa  176  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  63.43 
 
 
132 aa  176  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  63.43 
 
 
132 aa  176  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  61.94 
 
 
132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  60.45 
 
 
132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  62.12 
 
 
132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  61.19 
 
 
131 aa  170  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  60.61 
 
 
132 aa  169  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 
132 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 
132 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  60.61 
 
 
130 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  59.7 
 
 
131 aa  168  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  61.94 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  57.46 
 
 
132 aa  163  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  61.36 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 
132 aa  161  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  60.61 
 
 
132 aa  161  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 
132 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  61.07 
 
 
132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 
132 aa  160  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  56.82 
 
 
132 aa  160  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  58.96 
 
 
132 aa  160  7e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 
132 aa  159  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  58.21 
 
 
132 aa  159  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  59.09 
 
 
132 aa  157  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  53.73 
 
 
132 aa  157  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  56.72 
 
 
132 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  56.72 
 
 
132 aa  155  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  57.46 
 
 
136 aa  154  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
132 aa  154  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
132 aa  154  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 
131 aa  154  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  59.4 
 
 
133 aa  152  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
132 aa  150  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  56.06 
 
 
133 aa  149  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
131 aa  147  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
132 aa  147  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2605  30S ribosomal protein S8  57.46 
 
 
131 aa  147  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000206402  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2893  ribosomal protein S8  58.21 
 
 
131 aa  147  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  55.22 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  50.75 
 
 
132 aa  140  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  50.75 
 
 
132 aa  140  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1853  30S ribosomal protein S8  52.94 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.923356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  137  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  50.76 
 
 
132 aa  136  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  52.94 
 
 
136 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 
135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  50.37 
 
 
135 aa  134  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  51.88 
 
 
132 aa  134  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  133  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  133  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  54.55 
 
 
131 aa  133  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1161  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 
132 aa  133  9e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000284312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 
133 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  51.52 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1840  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  51.82 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0351  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
130 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000194247  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 
133 aa  131  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>