More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1304 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
193 aa  390  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
184 aa  373  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  82.78 
 
 
182 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1126  50S ribosomal protein L5  75.96 
 
 
184 aa  305  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0974998  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0778  50S ribosomal protein L5  67.58 
 
 
185 aa  276  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.807556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  67.61 
 
 
179 aa  248  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 
179 aa  245  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  64.25 
 
 
183 aa  244  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  63.22 
 
 
180 aa  238  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  235  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  62.15 
 
 
180 aa  235  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 
181 aa  234  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  232  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  231  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  231  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  231  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  231  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  231  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  231  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  60 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  231  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  231  7.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  230  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  229  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  229  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  230  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
180 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  229  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 
182 aa  229  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  229  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
182 aa  228  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  59.66 
 
 
180 aa  228  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  59.2 
 
 
179 aa  229  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 
182 aa  227  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  227  8e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  58.33 
 
 
191 aa  227  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 
180 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 
189 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  56 
 
 
182 aa  227  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 
180 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  226  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
198 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 
179 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 
179 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 
179 aa  225  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  57.14 
 
 
180 aa  225  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
180 aa  224  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
180 aa  224  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  58.62 
 
 
181 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  223  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
179 aa  222  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
179 aa  222  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  59.66 
 
 
184 aa  222  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  222  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 
179 aa  222  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
187 aa  222  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
180 aa  222  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 
180 aa  221  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
179 aa  221  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  58.29 
 
 
189 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2895  ribosomal protein L5  56.74 
 
 
182 aa  221  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  56 
 
 
178 aa  221  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
179 aa  221  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
179 aa  221  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  56.59 
 
 
193 aa  220  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  54.95 
 
 
193 aa  220  9e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  54.74 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17281  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.805696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  54.55 
 
 
179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
180 aa  218  3e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  57.71 
 
 
190 aa  218  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
180 aa  219  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
180 aa  218  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  58.29 
 
 
189 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
182 aa  218  5e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  218  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  57.71 
 
 
187 aa  217  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  52.27 
 
 
179 aa  218  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 
191 aa  217  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
180 aa  217  7.999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  217  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  55 
 
 
183 aa  217  8.999999999999998e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  54.86 
 
 
179 aa  217  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 
179 aa  217  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 
179 aa  216  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 
180 aa  217  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  216  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  54.21 
 
 
196 aa  215  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  53.93 
 
 
179 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  54.55 
 
 
179 aa  215  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
182 aa  216  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 
196 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
180 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  53.93 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  55.43 
 
 
191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  54.55 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  54.29 
 
 
180 aa  215  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>