More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1301 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
107 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  99.07 
 
 
107 aa  208  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  62.38 
 
 
100 aa  123  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 
99 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  71.43 
 
 
86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  70.89 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  71.62 
 
 
89 aa  110  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  68.06 
 
 
84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  67.09 
 
 
96 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  65.28 
 
 
84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 
88 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 
88 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  69.62 
 
 
89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  63.16 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
84 aa  107  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
84 aa  107  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  63.16 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
84 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
84 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
84 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
84 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
84 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  63.64 
 
 
84 aa  107  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  65.28 
 
 
84 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
88 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 
84 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
88 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
88 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
88 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 
84 aa  106  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  64.86 
 
 
84 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  67.53 
 
 
101 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  61.84 
 
 
91 aa  105  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  61.84 
 
 
91 aa  105  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  68.83 
 
 
85 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 
84 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  63.1 
 
 
86 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 
84 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  61.84 
 
 
84 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  62.5 
 
 
89 aa  105  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  62.5 
 
 
85 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
92 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  61.84 
 
 
84 aa  104  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 
84 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  65.38 
 
 
88 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  68.83 
 
 
99 aa  103  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  66.23 
 
 
94 aa  104  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  61.04 
 
 
85 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 
88 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 
89 aa  103  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  65.82 
 
 
85 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  64.86 
 
 
88 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 
88 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 
88 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 
84 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 
90 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 
88 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  61.04 
 
 
85 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
90 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  69.7 
 
 
88 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  59.55 
 
 
112 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 
92 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
90 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  67.53 
 
 
94 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3906  ribosomal protein s17  61.25 
 
 
88 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 
93 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  67.53 
 
 
85 aa  101  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 
102 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0781  ribosomal protein S17  48.15 
 
 
110 aa  101  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  65.28 
 
 
96 aa  101  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  59.49 
 
 
138 aa  100  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 
85 aa  100  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  71.21 
 
 
88 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 
90 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 
82 aa  100  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  64 
 
 
82 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 
84 aa  100  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  63.16 
 
 
88 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 
88 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2315  ribosomal protein S17  62.5 
 
 
86 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000099877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
82 aa  99.4  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  65.33 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 
92 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 
82 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  60.76 
 
 
85 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  60.81 
 
 
86 aa  99.4  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0235  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 
84 aa  99.8  1e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
82 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
82 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
82 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 
82 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  62.82 
 
 
93 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
86 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 
85 aa  99.4  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>