More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1287 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  100 
 
 
127 aa  252  1e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  7.77743e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  100 
 
 
127 aa  252  1e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  3.81794e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  88.71 
 
 
128 aa  225  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  3.91683e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  88.52 
 
 
134 aa  223  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  3.69356e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 
124 aa  221  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.00992e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 
124 aa  216  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 
135 aa  215  2e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  2.00867e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 
135 aa  215  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 
133 aa  213  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  5.41183e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  82.11 
 
 
124 aa  208  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.23739e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  206  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  79.67 
 
 
123 aa  201  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  9.46839e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  201  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.30783e-07  decreased coverage  1.90944e-21 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  74.64 
 
 
145 aa  201  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  2.5178e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  77.24 
 
 
124 aa  201  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  1.97086e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  200  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.69822e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  201  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  4.1416e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  201  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  200  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.1853e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
123 aa  199  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  199  1e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
123 aa  199  1e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
125 aa  199  1e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  5.75958e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  199  1e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
124 aa  199  1e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  6.71738e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  198  2e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  1.10265e-06  hitchhiker  3.99802e-09 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  85.37 
 
 
123 aa  198  2e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  197  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  7.38801e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
124 aa  197  4e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 
122 aa  197  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  72.86 
 
 
140 aa  197  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  4.99342e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  76.47 
 
 
137 aa  197  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
124 aa  196  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  196  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.17432e-05  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
124 aa  196  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  75 
 
 
124 aa  196  1e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  71.43 
 
 
140 aa  195  1e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.97858e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  76.86 
 
 
122 aa  196  1e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  77.24 
 
 
123 aa  195  1e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 
126 aa  195  1e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  8.79391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 
126 aa  195  1e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
124 aa  195  2e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  74.1 
 
 
139 aa  195  2e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.42047e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
124 aa  194  2e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.03953e-07  decreased coverage  9.87169e-06 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  195  2e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
124 aa  194  2e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  74.19 
 
 
124 aa  195  2e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
124 aa  194  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 
128 aa  194  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  7.03033e-07  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
136 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  76.23 
 
 
123 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  75.81 
 
 
124 aa  194  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
124 aa  194  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
123 aa  194  4e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
123 aa  194  4e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  79.34 
 
 
122 aa  194  4e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.58978e-12  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
124 aa  194  4e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
124 aa  194  4e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
124 aa  194  5e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  7.86754e-06  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  72.14 
 
 
140 aa  194  5e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.51619e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  72.14 
 
 
140 aa  194  5e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  4.59587e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  72.14 
 
 
140 aa  194  5e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  4.25498e-10  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 
124 aa  194  5e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  73.23 
 
 
127 aa  193  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  75.61 
 
 
124 aa  193  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  77.24 
 
 
124 aa  193  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  73.23 
 
 
127 aa  193  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  71.43 
 
 
140 aa  193  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  71.43 
 
 
140 aa  193  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.55228e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  71.43 
 
 
140 aa  193  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.68481e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  71.43 
 
 
140 aa  193  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.28293e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  71.43 
 
 
140 aa  193  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  71.43 
 
 
140 aa  193  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.47316e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  71.43 
 
 
140 aa  193  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.43353e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  73.98 
 
 
123 aa  193  8e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 
124 aa  193  8e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  192  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  2.84598e-07 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  71.43 
 
 
140 aa  193  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  8.14574e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
125 aa  192  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  73.02 
 
 
126 aa  192  9e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  192  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
123 aa  192  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 
123 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 
123 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
124 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 
123 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19521  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
124 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
124 aa  192  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 
129 aa  192  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  1.8595e-11  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  76.42 
 
 
123 aa  192  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  9.91521e-07  hitchhiker  8.0182e-06 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  75 
 
 
124 aa  192  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  2.65331e-06  hitchhiker  8.40597e-10 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
124 aa  192  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  6.30102e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 
123 aa  192  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 
123 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
124 aa  192  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
128 aa  192  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  5.94982e-05  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17021  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
124 aa  191  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17141  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
124 aa  191  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.387317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 
124 aa  191  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  72.58 
 
 
124 aa  191  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>