More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1280 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  94.66 
 
 
431 aa  845    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  100 
 
 
431 aa  877    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1514  NusB/RsmB/TIM44  44.16 
 
 
416 aa  361  2e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.164457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  39.67 
 
 
444 aa  256  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  36.32 
 
 
444 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  36.55 
 
 
444 aa  249  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  35.87 
 
 
444 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  36.1 
 
 
444 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  35.65 
 
 
444 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  36.32 
 
 
444 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  35.65 
 
 
444 aa  246  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  35.65 
 
 
444 aa  246  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  35.65 
 
 
444 aa  246  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  35.65 
 
 
444 aa  246  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  37.32 
 
 
448 aa  243  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  34.98 
 
 
452 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  36.03 
 
 
448 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  34.47 
 
 
455 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  34.48 
 
 
449 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  35.44 
 
 
453 aa  236  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  36.82 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  37.05 
 
 
448 aa  233  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  34.6 
 
 
444 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  36.1 
 
 
457 aa  229  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  33.7 
 
 
446 aa  226  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  33.58 
 
 
447 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  33.04 
 
 
451 aa  226  6e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  34.15 
 
 
453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.1 
 
 
449 aa  223  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  32.78 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  33.74 
 
 
452 aa  221  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  31.43 
 
 
444 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  33.58 
 
 
443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  32.76 
 
 
430 aa  217  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  32.82 
 
 
452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  30.88 
 
 
449 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  31.54 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  31.64 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  32.5 
 
 
446 aa  214  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  30.56 
 
 
468 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  33.5 
 
 
451 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  33.08 
 
 
451 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  33.08 
 
 
451 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  33.01 
 
 
449 aa  207  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  34.06 
 
 
440 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  32.13 
 
 
452 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  30.73 
 
 
442 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.73 
 
 
442 aa  206  9e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  31.87 
 
 
435 aa  204  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  31.27 
 
 
435 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  31.27 
 
 
435 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  36.6 
 
 
440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  30.1 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  32.45 
 
 
431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2516  hypothetical protein  33.25 
 
 
427 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  32.08 
 
 
456 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2646  hypothetical protein  33.25 
 
 
427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  33.66 
 
 
432 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  32.91 
 
 
437 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  30.46 
 
 
440 aa  194  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  32.27 
 
 
445 aa  192  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  34.42 
 
 
447 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  30.65 
 
 
436 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  31.31 
 
 
433 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  32 
 
 
429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  31.81 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  31.22 
 
 
438 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  31.81 
 
 
438 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  32 
 
 
444 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
438 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  31.46 
 
 
431 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  32.08 
 
 
453 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  30.23 
 
 
436 aa  186  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.25 
 
 
424 aa  186  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  30.09 
 
 
429 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  30.09 
 
 
429 aa  186  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  29.86 
 
 
429 aa  186  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  29.86 
 
 
429 aa  186  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  29.86 
 
 
429 aa  186  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  29.86 
 
 
429 aa  186  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  29.86 
 
 
429 aa  186  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  29.86 
 
 
429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  31.06 
 
 
449 aa  183  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  29.64 
 
 
429 aa  183  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  32.91 
 
 
432 aa  183  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  30.41 
 
 
451 aa  182  7e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  30.41 
 
 
429 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  29.08 
 
 
406 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  32.04 
 
 
448 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  32.62 
 
 
429 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  30.18 
 
 
429 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  31.44 
 
 
464 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  30.47 
 
 
427 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  30.41 
 
 
429 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  29.95 
 
 
429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  31.81 
 
 
442 aa  180  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  29.95 
 
 
429 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.77 
 
 
444 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  32.71 
 
 
429 aa  179  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  30.39 
 
 
427 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>