More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1276 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1410  amidohydrolase  92.16 
 
 
357 aa  685    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1276  amidohydrolase  100 
 
 
357 aa  735    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000371736  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1044  amidohydrolase  46.93 
 
 
364 aa  330  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0081  amidohydrolase  44.2 
 
 
369 aa  309  4e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348917  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1219  amidohydrolase  44.89 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0945  amidohydrolase  32.23 
 
 
376 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.74089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1824  amidohydrolase  31.49 
 
 
377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2682  amidohydrolase  31.49 
 
 
376 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000743905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4029  M20/M25/M40 family peptidase  31.02 
 
 
376 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3890  M20/M25/M40 family peptidase  30.75 
 
 
376 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3738  M20/M25/M40 family peptidase  30.75 
 
 
376 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4193  M20/M25/M40 family peptidase  30.75 
 
 
376 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3995  peptidase, M20/M25/M40 family  30.75 
 
 
376 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4100  peptidase, M20/M25/M40 family  30.75 
 
 
376 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0323014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4083  peptidase, M20/M25/M40 family  30.03 
 
 
376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3722  M20/M25/M40 family peptidase  30.75 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1157  peptidase, M20/M25/M40 family  30.03 
 
 
376 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3807  amidohydrolase  30.3 
 
 
376 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.393808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  31.82 
 
 
387 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  34.1 
 
 
390 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13725  predicted protein  32.65 
 
 
397 aa  171  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.829613  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2834  amidohydrolase  31.22 
 
 
375 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.132688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  29.95 
 
 
381 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  31.4 
 
 
379 aa  169  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  29.95 
 
 
381 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  29.95 
 
 
381 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  33.71 
 
 
392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  30.14 
 
 
398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  29.95 
 
 
381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  30.31 
 
 
385 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0773  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.93 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.197987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  30.79 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  30.22 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  30.03 
 
 
398 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  29.86 
 
 
386 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  29.12 
 
 
381 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0614  amidohydrolase  28.04 
 
 
381 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  29.89 
 
 
389 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0594  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  31.36 
 
 
381 aa  160  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00422123  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  29.44 
 
 
385 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  31.18 
 
 
396 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0294  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.46 
 
 
376 aa  159  6e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  28.57 
 
 
388 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  32.25 
 
 
396 aa  159  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  31.18 
 
 
388 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  33.24 
 
 
392 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  31.45 
 
 
395 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.43 
 
 
401 aa  155  8e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  31.08 
 
 
407 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  31.73 
 
 
395 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  30.87 
 
 
396 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  31.54 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  30.98 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  31.04 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  31.61 
 
 
373 aa  153  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  30.93 
 
 
391 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  30.51 
 
 
432 aa  153  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  30.87 
 
 
382 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  28.76 
 
 
393 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  30.35 
 
 
388 aa  152  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  31.03 
 
 
466 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3992  amidohydrolase  31.17 
 
 
385 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0968  amidohydrolase family protein  32.32 
 
 
383 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  30.93 
 
 
409 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3370  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase) (hippuricase)  30.03 
 
 
343 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534991  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  30.68 
 
 
399 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  30.63 
 
 
465 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  31.56 
 
 
397 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  31.61 
 
 
386 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  31.55 
 
 
396 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  29.38 
 
 
435 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  31.22 
 
 
408 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1918  amidohydrolase family protein  31.48 
 
 
372 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  31.54 
 
 
396 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  31.27 
 
 
396 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  32.34 
 
 
386 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  30.51 
 
 
465 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  32.07 
 
 
410 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  30.51 
 
 
465 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  32.32 
 
 
403 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0175  amidohydrolase  29.86 
 
 
386 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4183  amidohydrolase  31.01 
 
 
385 aa  149  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  31.13 
 
 
397 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  31 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  31.48 
 
 
402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  30.89 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  30.42 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  30.49 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  32.14 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  30.51 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  30.81 
 
 
386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  29.97 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  30.81 
 
 
394 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  31.3 
 
 
397 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  30.38 
 
 
471 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  30.81 
 
 
394 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  30.6 
 
 
393 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  31.67 
 
 
395 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  30.81 
 
 
449 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  31.55 
 
 
398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>