More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1246 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 955 aa  1932    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  96.44 
 
 		 955 aa  1879    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.72 
 
 		 989 aa  538  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.89 
 
 		 977 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.27 
 
 		 1035 aa  393  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.25 
 
 		 885 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.92 
 
 		 801 aa  365  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.12 
 
 		 788 aa  365  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.41 
 
 		 785 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.14 
 
 		 907 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.45 
 
 		 773 aa  353  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.78 
 
 		 732 aa  352  2e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.16 
 
 		 779 aa  352  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.18 
 
 		 779 aa  350  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.43 
 
 		 827 aa  350  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.98 
 
 		 779 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.63 
 
 		 779 aa  349  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  37 
 
 		 779 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  37 
 
 		 779 aa  349  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.63 
 
 		 779 aa  349  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.61 
 
 		 779 aa  348  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.61 
 
 		 779 aa  348  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.61 
 
 		 779 aa  347  7e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.23 
 
 		 586 aa  340  7e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.48 
 
 		 814 aa  338  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.4 
 
 		 570 aa  337  5.999999999999999e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.44 
 
 		 798 aa  336  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.22 
 
 		 831 aa  334  5e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.69 
 
 		 574 aa  332  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 573 aa  328  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  34.6 
 
 		 655 aa  327  4.0000000000000003e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  35.8 
 
 		 571 aa  324  6e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.63 
 
 		 568 aa  324  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.15 
 
 		 574 aa  323  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.9 
 
 		 566 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  35.92 
 
 		 736 aa  321  3e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35 
 
 		 571 aa  320  7e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.98 
 
 		 566 aa  318  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.08 
 
 		 566 aa  318  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.09 
 
 		 570 aa  319  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.58 
 
 		 573 aa  318  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.42 
 
 		 811 aa  319  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  36.88 
 
 		 932 aa  318  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.26 
 
 		 583 aa  318  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.71 
 
 		 573 aa  317  6e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_0208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.53 
 
 		 763 aa  316  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.31 
 
 		 568 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  34.2 
 
 		 592 aa  314  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.27 
 
 		 578 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  34.31 
 
 		 742 aa  314  5.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  34.21 
 
 		 568 aa  313  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.12 
 
 		 576 aa  312  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013525  Tter_1032  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.36 
 
 		 564 aa  308  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  33.52 
 
 		 568 aa  305  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  34.56 
 
 		 578 aa  303  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002620  TC0732  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.33 
 
 		 582 aa  302  2e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.213373  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.21 
 
 		 569 aa  301  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.91 
 
 		 564 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.02 
 
 		 572 aa  300  9e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.83 
 
 		 587 aa  299  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.65 
 
 		 757 aa  298  3e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.53 
 
 		 599 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.65 
 
 		 573 aa  297  7e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.15 
 
 		 579 aa  296  1e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.46 
 
 		 757 aa  296  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.46 
 
 		 757 aa  296  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.84 
 
 		 573 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_0876  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.29 
 
 		 592 aa  295  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0250964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.78 
 
 		 857 aa  295  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.94 
 
 		 568 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.16 
 
 		 579 aa  293  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  32.62 
 
 		 566 aa  293  1e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.26 
 
 		 572 aa  292  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  32.14 
 
 		 756 aa  292  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_2314  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.65 
 
 		 560 aa  291  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.843202  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.53 
 
 		 592 aa  290  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  32.77 
 
 		 574 aa  290  8e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.83 
 
 		 655 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.76 
 
 		 911 aa  290  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.83 
 
 		 655 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.34 
 
 		 592 aa  289  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.46 
 
 		 589 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  34.24 
 
 		 606 aa  288  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1070  single-stranded DNA-specific exonuclease  32.86 
 
 		 622 aa  288  4e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.55 
 
 		 865 aa  288  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3186  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.27 
 
 		 846 aa  287  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.35 
 
 		 573 aa  287  8e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  34.19 
 
 		 584 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.92 
 
 		 568 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.91 
 
 		 577 aa  282  2e-74  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4538  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.48 
 
 		 813 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.954569 
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.07 
 
 		 567 aa  281  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.77 
 
 		 574 aa  281  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.28 
 
 		 654 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.34 
 
 		 584 aa  280  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 584 aa  280  1e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.2 
 
 		 570 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.9 
 
 		 864 aa  278  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  32.31 
 
 		 684 aa  277  7e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013223  Dret_0292  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.91 
 
 		 577 aa  274  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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