135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1207 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 417 aa  833    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  99.76 
 
 		 417 aa  830    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  64.36 
 
 		 412 aa  535  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  59.8 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  51.85 
 
 		 403 aa  427  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  50.86 
 
 		 410 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  45.48 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  46.29 
 
 		 459 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  45.6 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  43.02 
 
 		 443 aa  302  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  44.01 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  44.42 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  44.75 
 
 		 439 aa  292  8e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  45.9 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  39.95 
 
 		 486 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  39.53 
 
 		 440 aa  283  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  39.77 
 
 		 440 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  41.94 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  45.24 
 
 		 428 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  44.72 
 
 		 448 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  39.81 
 
 		 440 aa  279  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  39.9 
 
 		 422 aa  279  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  39.28 
 
 		 428 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  40.91 
 
 		 424 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  39.28 
 
 		 448 aa  277  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  43.73 
 
 		 439 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  43.48 
 
 		 458 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  41 
 
 		 424 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  43.18 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  43.49 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  41 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  41 
 
 		 424 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  39.81 
 
 		 426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  40.76 
 
 		 424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  39 
 
 		 426 aa  273  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  38.78 
 
 		 421 aa  272  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  38.55 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  39.31 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  39.66 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  39.91 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  37.35 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  38.2 
 
 		 420 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  41.24 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  43.61 
 
 		 435 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  37.41 
 
 		 419 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  37.93 
 
 		 421 aa  263  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  39.38 
 
 		 423 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  39.62 
 
 		 452 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  40.46 
 
 		 428 aa  262  8e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  41.03 
 
 		 446 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  41.27 
 
 		 420 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  39.09 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  38.93 
 
 		 424 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  38.85 
 
 		 452 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  39.9 
 
 		 448 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  35.55 
 
 		 496 aa  256  7e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  38.61 
 
 		 421 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  41.94 
 
 		 443 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  40.96 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  40.91 
 
 		 422 aa  252  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  38.92 
 
 		 418 aa  252  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  40.96 
 
 		 413 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  41.11 
 
 		 447 aa  249  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  41.45 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  39.41 
 
 		 454 aa  246  8e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  40.11 
 
 		 460 aa  242  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  39.09 
 
 		 424 aa  240  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  37.88 
 
 		 439 aa  240  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  37.86 
 
 		 427 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  40.95 
 
 		 419 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  39.45 
 
 		 437 aa  239  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  40.81 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  39.45 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  36.95 
 
 		 439 aa  236  4e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  40.77 
 
 		 504 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  39.83 
 
 		 411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  39.08 
 
 		 423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  40.28 
 
 		 439 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  36.57 
 
 		 404 aa  232  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  40.78 
 
 		 423 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  39.9 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  39.34 
 
 		 435 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  40.57 
 
 		 434 aa  229  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  35.55 
 
 		 445 aa  228  1e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  39.07 
 
 		 444 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  38.27 
 
 		 412 aa  227  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  39 
 
 		 419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  38.75 
 
 		 428 aa  226  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  39.42 
 
 		 409 aa  226  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  37.86 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3471  hydroxypyruvate reductase  40.73 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.500752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  41.9 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56499  predicted protein  38.66 
 
 		 625 aa  224  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  39.46 
 
 		 374 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  39.71 
 
 		 434 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  39.22 
 
 		 437 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  40.9 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  35.57 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  37.53 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  36.75 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>