217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1202 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1202  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1254  50S ribosomal protein L35  90.77 
 
 		 65 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00450085  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0661  50S ribosomal protein L35  67.19 
 
 		 67 aa  87.4  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0924  50S ribosomal protein L35  71.43 
 
 		 72 aa  87.4  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000127679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1677  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0163169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  51.61 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0223  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.0000237579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  44.44 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0679  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000758197  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0346  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  50.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  45.16 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  44.44 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2384  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176561  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0294  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  46.55 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0034  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0269  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0710  ribosomal protein L35  45 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3042  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  46.88 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0241  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl189  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172022  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  49.21 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_657  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000644452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  46.3 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0204  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0083  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000192427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>