More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1165 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
186 aa  376  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  94.62 
 
 
186 aa  359  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  53.26 
 
 
180 aa  189  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  48.65 
 
 
187 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.45 
 
 
187 aa  174  7e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 
199 aa  169  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  44.68 
 
 
194 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.63 
 
 
191 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 
188 aa  159  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  44.05 
 
 
190 aa  157  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  44.05 
 
 
190 aa  157  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.46 
 
 
213 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
185 aa  154  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.56 
 
 
193 aa  153  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 
190 aa  153  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 
189 aa  153  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 
190 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.9 
 
 
186 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 
195 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  42.27 
 
 
219 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 
189 aa  152  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1451  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 
191 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.810799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  43.62 
 
 
188 aa  151  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 
210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  43.62 
 
 
188 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  42.35 
 
 
209 aa  150  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 
191 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0163  aminoacyl-tRNA hydrolase  53.01 
 
 
158 aa  148  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.02 
 
 
206 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
186 aa  147  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 
207 aa  147  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0968  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  43.62 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  43.62 
 
 
189 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 
208 aa  144  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
196 aa  144  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
192 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
192 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
192 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 
191 aa  144  9e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 
190 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
217 aa  142  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 
197 aa  141  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  40.8 
 
 
213 aa  141  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
195 aa  141  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 
185 aa  141  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 
193 aa  140  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 
192 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 
365 aa  139  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  39.68 
 
 
190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  37.77 
 
 
192 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 
188 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
206 aa  137  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 
188 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  39.49 
 
 
206 aa  137  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
214 aa  137  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1128  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 
225 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
190 aa  136  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  40.78 
 
 
181 aa  137  1e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 
190 aa  136  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
188 aa  136  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  38.95 
 
 
213 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  41.99 
 
 
189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  42.44 
 
 
205 aa  134  7.000000000000001e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.63 
 
 
207 aa  134  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  40.34 
 
 
209 aa  134  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  38.54 
 
 
206 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  42.63 
 
 
202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  35.53 
 
 
201 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 
228 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 
202 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  36.56 
 
 
217 aa  131  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02731  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 
198 aa  131  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 
191 aa  131  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 
189 aa  131  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 
202 aa  131  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>