More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1133 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
395 aa  805  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  9.72386e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  81.42 
 
 
395 aa  675  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  7.85421e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  80.3 
 
 
396 aa  672  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
395 aa  805  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  1.11198e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  72.25 
 
 
401 aa  589  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  68.18 
 
 
396 aa  570  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  68.1 
 
 
395 aa  567  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.09499e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  67.95 
 
 
397 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  4.60807e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
396 aa  561  1e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.21578e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  69.41 
 
 
402 aa  560  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  69.23 
 
 
393 aa  559  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  67.44 
 
 
403 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  68.21 
 
 
403 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 
396 aa  554  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  65.04 
 
 
396 aa  545  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 
395 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 
396 aa  543  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 
399 aa  538  1e-152  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  66.06 
 
 
396 aa  539  1e-152  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.48916e-06  hitchhiker  1.46833e-06 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  65.81 
 
 
397 aa  540  1e-152  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
399 aa  540  1e-152  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  3.63625e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
399 aa  539  1e-152  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
399 aa  538  1e-152  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
399 aa  539  1e-152  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  65.04 
 
 
395 aa  538  1e-152  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  9.69915e-11  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
399 aa  540  1e-152  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
399 aa  539  1e-152  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  5.2915e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
399 aa  539  1e-152  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
399 aa  539  1e-152  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 
399 aa  537  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  64.71 
 
 
396 aa  536  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  6.96498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  65.73 
 
 
391 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 
399 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 
402 aa  537  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  65.73 
 
 
391 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  64.19 
 
 
395 aa  532  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  65.31 
 
 
398 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  63.89 
 
 
405 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  64.69 
 
 
405 aa  528  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  65.31 
 
 
398 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  65.15 
 
 
397 aa  526  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  5.78039e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  65.4 
 
 
397 aa  525  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  63.8 
 
 
403 aa  527  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  63.64 
 
 
405 aa  524  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  62.72 
 
 
406 aa  522  1e-147  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  68.19 
 
 
412 aa  521  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  62.53 
 
 
403 aa  520  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  63.43 
 
 
402 aa  517  1e-145  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.5014e-06  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  61.95 
 
 
406 aa  517  1e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  62.21 
 
 
406 aa  516  1e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  65.74 
 
 
395 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  63.41 
 
 
395 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  63.04 
 
 
399 aa  508  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  63.66 
 
 
403 aa  506  1e-142  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  62.85 
 
 
397 aa  506  1e-142  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  62.72 
 
 
391 aa  507  1e-142  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  64.12 
 
 
396 aa  506  1e-142  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  4.74907e-06 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  63.01 
 
 
391 aa  505  1e-142  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  63.94 
 
 
397 aa  504  1e-142  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  62.97 
 
 
398 aa  505  1e-142  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  62.24 
 
 
397 aa  506  1e-142  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  61.48 
 
 
388 aa  503  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  62.18 
 
 
414 aa  503  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  63.94 
 
 
397 aa  501  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  63.36 
 
 
400 aa  502  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  64.68 
 
 
399 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  63.38 
 
 
399 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 
399 aa  501  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  63.1 
 
 
411 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  64.1 
 
 
395 aa  498  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  64.71 
 
 
417 aa  498  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  59.18 
 
 
393 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 
399 aa  498  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  61.18 
 
 
383 aa  494  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  59.18 
 
 
393 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  61.18 
 
 
383 aa  495  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  61.22 
 
 
402 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1853  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 
399 aa  494  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0451389  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  63.71 
 
 
389 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.34106e-15  hitchhiker  2.1958e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  61.18 
 
 
383 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1315  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 
398 aa  498  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119396  normal  0.284127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  61.18 
 
 
383 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  61.28 
 
 
398 aa  495  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  60.97 
 
 
389 aa  495  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 
384 aa  492  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 
384 aa  493  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 
384 aa  491  1e-138  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 
384 aa  491  1e-138  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 
384 aa  493  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  60.41 
 
 
384 aa  491  1e-138  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  61.31 
 
 
403 aa  491  1e-138  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 
384 aa  491  1e-138  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 
403 aa  491  1e-138  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 
384 aa  491  1e-138  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  60.91 
 
 
384 aa  492  1e-138  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  60.72 
 
 
390 aa  491  1e-138  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  60.91 
 
 
384 aa  492  1e-138  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  60.93 
 
 
383 aa  493  1e-138  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  61.48 
 
 
398 aa  493  1e-138  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  60.41 
 
 
384 aa  491  1e-138  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>