More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1031 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  100 
 
 
451 aa  911    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  100 
 
 
451 aa  911    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  61.37 
 
 
445 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  60.53 
 
 
446 aa  554  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  56.6 
 
 
456 aa  509  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  51.26 
 
 
448 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  48.19 
 
 
459 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  49.89 
 
 
453 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  48.24 
 
 
456 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  48.97 
 
 
454 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  48.28 
 
 
454 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  47.67 
 
 
444 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  47.43 
 
 
445 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  49.54 
 
 
449 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  47.2 
 
 
442 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  47.76 
 
 
481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  48.12 
 
 
471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  47.8 
 
 
456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  48.17 
 
 
442 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  49.32 
 
 
449 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  49.54 
 
 
449 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  48.76 
 
 
447 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  48.87 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  48.42 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  46.45 
 
 
453 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  46.68 
 
 
453 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  46.45 
 
 
449 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  46.68 
 
 
453 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  46.68 
 
 
453 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  46.68 
 
 
453 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  47.84 
 
 
456 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  46.68 
 
 
453 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  46.68 
 
 
453 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  46.58 
 
 
446 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  47.6 
 
 
453 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  46.68 
 
 
453 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  44.66 
 
 
466 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  44.66 
 
 
466 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  44.44 
 
 
466 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  47.27 
 
 
456 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  48.17 
 
 
445 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  46.22 
 
 
446 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  44.5 
 
 
441 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  46.95 
 
 
470 aa  387  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  43.95 
 
 
481 aa  386  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  48.11 
 
 
450 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  45.98 
 
 
508 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  47.65 
 
 
451 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  45.8 
 
 
457 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  45.8 
 
 
457 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  46.68 
 
 
447 aa  381  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  45.68 
 
 
476 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  45.35 
 
 
465 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  45.7 
 
 
469 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  45.15 
 
 
444 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  44.27 
 
 
462 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  45.23 
 
 
476 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  43.46 
 
 
454 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  46.78 
 
 
473 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  46.36 
 
 
472 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  46.97 
 
 
456 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  46.36 
 
 
472 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  45.68 
 
 
513 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  45.27 
 
 
472 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  43.65 
 
 
468 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  43.65 
 
 
468 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  45.82 
 
 
444 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  45.45 
 
 
461 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  45.13 
 
 
444 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  45.13 
 
 
439 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  45.51 
 
 
477 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  43.65 
 
 
468 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  43.65 
 
 
468 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  45.35 
 
 
463 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  45.09 
 
 
472 aa  371  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  44.37 
 
 
469 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  44.79 
 
 
446 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  46.15 
 
 
443 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  43.21 
 
 
468 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  44.67 
 
 
442 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  43.15 
 
 
452 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  45 
 
 
471 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  42.98 
 
 
468 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  42.98 
 
 
468 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  44.8 
 
 
468 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  43.21 
 
 
468 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2007  replicative DNA helicase  45.82 
 
 
458 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  45.25 
 
 
472 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  42.76 
 
 
468 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  42.76 
 
 
468 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  45 
 
 
471 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  45.43 
 
 
460 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  43.21 
 
 
468 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  41.67 
 
 
457 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  42.99 
 
 
468 aa  363  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  48.05 
 
 
441 aa  363  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  45.12 
 
 
463 aa  363  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  41.88 
 
 
451 aa  363  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  44.9 
 
 
525 aa  363  4e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  43.21 
 
 
468 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>