More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1003 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
156 aa  310  6e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  8.18068e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  63.82 
 
 
153 aa  205  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  63.58 
 
 
151 aa  194  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  60.81 
 
 
150 aa  194  5e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  56.29 
 
 
151 aa  182  2e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  55.13 
 
 
158 aa  182  2e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.30508e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  58.5 
 
 
150 aa  179  9e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  58.5 
 
 
150 aa  179  9e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
150 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.32804e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  58.33 
 
 
163 aa  178  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  57.04 
 
 
156 aa  178  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  57.89 
 
 
158 aa  178  3e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  54.3 
 
 
153 aa  177  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.23148e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
150 aa  177  6e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  7.94729e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  59.86 
 
 
150 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
150 aa  173  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
153 aa  174  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  51.3 
 
 
154 aa  173  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.39578e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  56.86 
 
 
153 aa  173  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.19407e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  56.86 
 
 
153 aa  173  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  6.0118e-09  unclonable  2.02968e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  56.86 
 
 
153 aa  173  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.76675e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  56.86 
 
 
153 aa  173  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.14279e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  56.86 
 
 
153 aa  173  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.81177e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  56.86 
 
 
153 aa  173  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.65338e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  56.86 
 
 
153 aa  173  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  56.86 
 
 
153 aa  173  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  3.83164e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  56.86 
 
 
153 aa  173  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.78124e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  56.03 
 
 
156 aa  172  1e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  53.59 
 
 
155 aa  172  1e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  56.03 
 
 
156 aa  172  1e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  56.86 
 
 
153 aa  171  3e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  4.07341e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
154 aa  170  8e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 
150 aa  169  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.02337e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 
150 aa  169  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  4.06382e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  56.21 
 
 
153 aa  169  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.09294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 
153 aa  169  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  55.13 
 
 
156 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  53.19 
 
 
154 aa  168  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  6.21144e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  55.77 
 
 
155 aa  167  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  55.77 
 
 
155 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
157 aa  167  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  55.56 
 
 
162 aa  167  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  52.32 
 
 
157 aa  166  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  52.32 
 
 
157 aa  166  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.36219e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  55.33 
 
 
172 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  49.35 
 
 
154 aa  164  3e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.5641e-05  hitchhiker  1.28798e-12 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 
159 aa  165  3e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  53.57 
 
 
151 aa  164  3e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.41232e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
153 aa  164  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  5.61851e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  53.29 
 
 
163 aa  164  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  57.05 
 
 
176 aa  164  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  53.38 
 
 
150 aa  164  6e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  4.56921e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 
159 aa  163  6e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  1.6324e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 
147 aa  163  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  50 
 
 
148 aa  163  9e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  9.98314e-07  hitchhiker  1.75991e-13 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
154 aa  162  1e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
147 aa  162  1e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  2.47789e-07  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  51.95 
 
 
165 aa  162  2e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 
155 aa  161  2e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 
161 aa  161  2e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
149 aa  162  2e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
175 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
154 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 
149 aa  161  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  53.02 
 
 
172 aa  161  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  51.95 
 
 
154 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
149 aa  161  4e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 
149 aa  161  4e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
152 aa  160  5e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  51.3 
 
 
154 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 
151 aa  160  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  52.67 
 
 
154 aa  160  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  51.3 
 
 
154 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  51.7 
 
 
170 aa  160  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
154 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  54.42 
 
 
176 aa  160  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
150 aa  160  8e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 
154 aa  160  8e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
149 aa  160  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  2.01211e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 
149 aa  160  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  56.43 
 
 
156 aa  159  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 
157 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
149 aa  159  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  1.6525e-08 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3101  ATP-cone domain protein  52.38 
 
 
147 aa  158  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2928  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 
147 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  50.64 
 
 
174 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
154 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
149 aa  157  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2875  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 
149 aa  157  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.591342  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
149 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
149 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  157  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  157  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
149 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
149 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  157  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
149 aa  157  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1562  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 
154 aa  155  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000599658  normal  0.0421133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>