More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1001 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  65.74 
 
 
502 aa  704  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
502 aa  1011  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  3.93607e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  60.16 
 
 
502 aa  644  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  64.89 
 
 
509 aa  677  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  99.8 
 
 
502 aa  1010  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 
491 aa  539  1e-152  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.53681e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  55.19 
 
 
499 aa  532  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  7.14975e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
489 aa  529  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
493 aa  523  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
489 aa  511  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  1.6249e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
510 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  1.27982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 
497 aa  506  1e-142  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  8.63751e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 
489 aa  503  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.38438e-06  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  52.93 
 
 
494 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
512 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
512 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
505 aa  501  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
494 aa  499  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
495 aa  499  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
499 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.60184e-08  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
573 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 
494 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 
515 aa  498  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
488 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.42799e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
561 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
573 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 
515 aa  498  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
573 aa  493  1e-138  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
504 aa  493  1e-138  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
508 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
504 aa  488  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
501 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
490 aa  491  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  2.75305e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
501 aa  490  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
509 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
488 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
503 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
499 aa  487  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
499 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.36352e-10 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
499 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
499 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
499 aa  482  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  3.41012e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
499 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
499 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
499 aa  482  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
499 aa  482  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
499 aa  481  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  1.72197e-09 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
512 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
513 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 
499 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
497 aa  475  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
496 aa  476  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
492 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
513 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
508 aa  477  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.49631e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
504 aa  476  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
496 aa  474  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
496 aa  471  1e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
523 aa  468  1e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
495 aa  469  1e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  1.64497e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
508 aa  471  1e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
502 aa  469  1e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
501 aa  471  1e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
532 aa  470  1e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
494 aa  466  1e-130  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
501 aa  465  1e-130  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
501 aa  465  1e-130  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
631 aa  467  1e-130  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
507 aa  465  1e-130  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  47.87 
 
 
491 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 
502 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
492 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
492 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
491 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
502 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
494 aa  461  1e-128  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
503 aa  460  1e-128  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
514 aa  459  1e-128  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0450  lysyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
501 aa  461  1e-128  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
489 aa  459  1e-128  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0424  lysyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
501 aa  460  1e-128  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0159622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
496 aa  458  1e-128  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1556  lysyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
501 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
505 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 
577 aa  457  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  9.7302e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
509 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
511 aa  456  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
489 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  3.78083e-06 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
496 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
647 aa  453  1e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  9.3194e-05  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1349  lysyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 
503 aa  454  1e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  6.70094e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
494 aa  454  1e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  8.657e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0225  lysyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
503 aa  454  1e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
484 aa  452  1e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
508 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 
508 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1646  lysyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
499 aa  451  1e-125  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
1118 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
578 aa  447  1e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>