More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0980 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0980  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 71 aa  149  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000192079  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1150  50S ribosomal protein L31  98.59 
 
 		 71 aa  147  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000442402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1165  50S ribosomal protein L31  76.12 
 
 		 69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000036585  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1806  50S ribosomal protein L31  72.46 
 
 		 71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000545345  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0169  50S ribosomal protein L31  64.79 
 
 		 70 aa  104  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457438  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  50 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  52.94 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  51.47 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  51.47 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  50 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  49.28 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 76 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  51.43 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  51.47 
 
 		 66 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 72 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  47.83 
 
 		 74 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  50 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  51.47 
 
 		 66 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  51.47 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  47.83 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  50 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  50 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  48.53 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  47.83 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  50 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  50.72 
 
 		 77 aa  70.1  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  48.57 
 
 		 72 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  49.28 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  51.47 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  48.53 
 
 		 73 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  45.59 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  48.57 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  48.53 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  44.12 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  47.83 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  48.53 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  52.17 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  51.47 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  52.17 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  45.59 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  42.86 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  44.93 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  46.48 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 74 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  48.53 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  50 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  47.83 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2003  ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14904  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  47.83 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  50 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  48.57 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  47.83 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  49.28 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  44.44 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  48.57 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  42.86 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf449  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0818  ribosomal protein L31  48.53 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000168077  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  48.57 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  41.43 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  46.48 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1060  ribosomal protein L31  50 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431965  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  47.89 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  47.22 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  42.65 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  48.57 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  46.48 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>