More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0953 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  43.45 
 
 		 838 aa  691    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  57.47 
 
 		 836 aa  987    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 814 aa  1667    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  36.39 
 
 		 885 aa  528  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  32.72 
 
 		 510 aa  229  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  31.02 
 
 		 511 aa  226  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  32.2 
 
 		 526 aa  205  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  30.09 
 
 		 620 aa  203  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  35.71 
 
 		 649 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.62 
 
 		 1891 aa  192  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  27.15 
 
 		 1017 aa  191  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  31.32 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  27.68 
 
 		 1005 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  30.74 
 
 		 609 aa  187  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  28.72 
 
 		 1942 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  29.76 
 
 		 614 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  27.73 
 
 		 610 aa  183  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  29.11 
 
 		 739 aa  183  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  32.96 
 
 		 642 aa  180  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  27.34 
 
 		 925 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  29.89 
 
 		 622 aa  171  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  27.15 
 
 		 723 aa  168  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  29.49 
 
 		 600 aa  168  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.8 
 
 		 1855 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.77 
 
 		 1975 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.52 
 
 		 588 aa  161  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  30.16 
 
 		 490 aa  160  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  27.8 
 
 		 484 aa  157  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  29.05 
 
 		 599 aa  157  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  29.49 
 
 		 619 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  28.22 
 
 		 703 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  30.07 
 
 		 1021 aa  151  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  29.56 
 
 		 593 aa  151  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  28.03 
 
 		 606 aa  151  6e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  28.03 
 
 		 606 aa  151  6e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  28.05 
 
 		 767 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 623 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  30.12 
 
 		 564 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  28.68 
 
 		 462 aa  148  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  27.36 
 
 		 2638 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  27.92 
 
 		 582 aa  147  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  27.06 
 
 		 686 aa  147  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  26.83 
 
 		 589 aa  147  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  26.78 
 
 		 559 aa  146  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  27.17 
 
 		 635 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  26.3 
 
 		 752 aa  146  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  26.45 
 
 		 604 aa  144  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  27.1 
 
 		 528 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  26.27 
 
 		 574 aa  144  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  27.48 
 
 		 686 aa  144  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  26.82 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.3 
 
 		 2068 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  26.39 
 
 		 690 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  27.7 
 
 		 742 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  28.57 
 
 		 532 aa  141  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  25.31 
 
 		 586 aa  140  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  29.79 
 
 		 623 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  25.31 
 
 		 586 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  28.3 
 
 		 572 aa  139  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  27.74 
 
 		 624 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  27.26 
 
 		 630 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  26.38 
 
 		 620 aa  137  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  24.24 
 
 		 586 aa  135  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  26.64 
 
 		 587 aa  135  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  26.96 
 
 		 631 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  26.29 
 
 		 586 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  26.29 
 
 		 622 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  28.37 
 
 		 561 aa  134  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  25.41 
 
 		 586 aa  134  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  24.05 
 
 		 586 aa  134  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  24.05 
 
 		 586 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  24.05 
 
 		 586 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  24.62 
 
 		 586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  27.57 
 
 		 576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  26.56 
 
 		 584 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  26.28 
 
 		 521 aa  132  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  25.73 
 
 		 586 aa  132  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  26.15 
 
 		 583 aa  132  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  25.84 
 
 		 481 aa  132  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  26.32 
 
 		 472 aa  132  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  23.34 
 
 		 586 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  28.07 
 
 		 654 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  26.44 
 
 		 617 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  26.39 
 
 		 533 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  26.97 
 
 		 741 aa  130  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  26.68 
 
 		 663 aa  130  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  27.07 
 
 		 617 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  27.63 
 
 		 694 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  26.67 
 
 		 683 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  26.58 
 
 		 571 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  25.71 
 
 		 515 aa  128  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  26.98 
 
 		 575 aa  128  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  25.15 
 
 		 676 aa  127  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  25.15 
 
 		 676 aa  127  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  27.31 
 
 		 477 aa  127  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  25.14 
 
 		 676 aa  127  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  25.15 
 
 		 676 aa  127  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  25.14 
 
 		 676 aa  127  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  25.96 
 
 		 574 aa  127  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  25.14 
 
 		 676 aa  127  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>