105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0912 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0912  ferredoxin-like protein  100 
 
 		 126 aa  248  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0934  ferredoxin-like protein  100 
 
 		 126 aa  248  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0994  ferredoxin-like protein  81.6 
 
 		 126 aa  204  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1171  ferredoxin-like protein  72 
 
 		 125 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0098  ferredoxin-like protein  46.28 
 
 		 124 aa  115  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000332289 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0918  NADP-reducing hydrogenase, subunit B  47.93 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  45 
 
 		 619 aa  106  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1297  hypothetical protein  38.98 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0174  NADP-reducing hydrogenase, subunit B  41.88 
 
 		 119 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0340  ferredoxin  39.34 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000592647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2140  hypothetical protein  39.02 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2234  ferredoxin  40.65 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3803  hypothetical protein  38.66 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0725  NADH dehydrogenase (quinone)  42.15 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0148  NADP-reducing hydrogenase chain B  37.7 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  43.48 
 
 		 619 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1845  NADP-reducing hydrogenase chain B  35.48 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1635  NADP-reducing hydrogenase chain B  35 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000061136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3517  NADP-reducing hydrogenase, subunit B  33.91 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1603  NADP-reducing hydrogenase chain B  35.34 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  38.21 
 
 		 572 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  38.71 
 
 		 571 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.5 
 
 		 677 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  34.83 
 
 		 617 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  36.73 
 
 		 596 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  31.09 
 
 		 562 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  36.17 
 
 		 607 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  36.17 
 
 		 607 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  34.43 
 
 		 575 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  39.13 
 
 		 602 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  35.96 
 
 		 604 aa  60.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  40.7 
 
 		 569 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  36.26 
 
 		 610 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  34.02 
 
 		 668 aa  57.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  31.5 
 
 		 569 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  38.37 
 
 		 570 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  35.87 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0844  NADH dehydrogenase (quinone)  29.75 
 
 		 562 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0257852  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  39.56 
 
 		 596 aa  54.3  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  30.53 
 
 		 588 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  32.65 
 
 		 597 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  32.65 
 
 		 226 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  34.07 
 
 		 594 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 		 634 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  33.71 
 
 		 596 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  27.35 
 
 		 217 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  31.52 
 
 		 597 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  29.13 
 
 		 552 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  31.18 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  32.26 
 
 		 592 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  32.61 
 
 		 595 aa  50.1  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 		 598 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  29.37 
 
 		 614 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1489  NADH dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 		 570 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  33.06 
 
 		 562 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  32.14 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  30.58 
 
 		 636 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  28.74 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  28.91 
 
 		 623 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  29.76 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  29.75 
 
 		 636 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  27.59 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  30.38 
 
 		 590 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  28.83 
 
 		 623 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  26.72 
 
 		 572 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  39.06 
 
 		 597 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  28.57 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1539  NADH dehydrogenase (quinone)  23.21 
 
 		 580 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  32.23 
 
 		 635 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 		 624 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.59 
 
 		 408 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  32.97 
 
 		 593 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1539  hypothetical protein  26.79 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2241  hypothetical protein  31.96 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  31.52 
 
 		 597 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  37.29 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0844  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.19 
 
 		 291 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.923972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  32.98 
 
 		 538 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  25.49 
 
 		 632 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  27.66 
 
 		 594 aa  43.9  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  28.75 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  42.37 
 
 		 603 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  27.38 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  32.93 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  34.15 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.55 
 
 		 410 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  37.23 
 
 		 597 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.37 
 
 		 410 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  28.57 
 
 		 623 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  35.71 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  28.85 
 
 		 103 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0160  hypothetical protein  26.45 
 
 		 290 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.87 
 
 		 593 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  36.21 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  28.8 
 
 		 620 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  30 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  30.43 
 
 		 629 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>