165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0863 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 1059 aa  2166    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  55.51 
 
 		 1041 aa  1149    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  99.81 
 
 		 1059 aa  2163    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  71.63 
 
 		 1020 aa  1489    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  48.93 
 
 		 1037 aa  955    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  34.66 
 
 		 1018 aa  558  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.36 
 
 		 697 aa  549  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  38.27 
 
 		 689 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  32.39 
 
 		 1019 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  61.06 
 
 		 1478 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  32.37 
 
 		 1780 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  30.14 
 
 		 1215 aa  355  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.03 
 
 		 1146 aa  335  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  37.25 
 
 		 619 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  33.56 
 
 		 1050 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  37.69 
 
 		 756 aa  318  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  30.21 
 
 		 912 aa  300  8e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  49.25 
 
 		 323 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  46.45 
 
 		 331 aa  289  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  30.36 
 
 		 1495 aa  285  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  31.71 
 
 		 690 aa  269  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  43.24 
 
 		 366 aa  269  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  42.01 
 
 		 338 aa  260  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  42.6 
 
 		 321 aa  254  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  43.88 
 
 		 359 aa  244  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  42.86 
 
 		 423 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  40.05 
 
 		 407 aa  241  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  40.85 
 
 		 324 aa  240  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  32.75 
 
 		 1077 aa  240  9e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  37.96 
 
 		 374 aa  239  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  40.35 
 
 		 337 aa  235  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  28.82 
 
 		 1331 aa  224  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  35.67 
 
 		 837 aa  205  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  39.94 
 
 		 382 aa  204  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  30.76 
 
 		 806 aa  204  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  52.04 
 
 		 215 aa  203  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  39.07 
 
 		 347 aa  201  7e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  36.05 
 
 		 2457 aa  200  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  38.74 
 
 		 347 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  36.34 
 
 		 333 aa  192  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  36.83 
 
 		 371 aa  192  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  37.05 
 
 		 369 aa  191  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  35.35 
 
 		 815 aa  189  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  35.85 
 
 		 457 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  30.02 
 
 		 1242 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  33.05 
 
 		 370 aa  185  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  35.89 
 
 		 474 aa  179  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  34.32 
 
 		 423 aa  179  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  35.71 
 
 		 328 aa  176  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  34.38 
 
 		 495 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  33.96 
 
 		 497 aa  175  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  36.36 
 
 		 491 aa  173  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  35.35 
 
 		 472 aa  173  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  37.69 
 
 		 488 aa  167  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  34.59 
 
 		 474 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  28.14 
 
 		 639 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  34.39 
 
 		 1001 aa  166  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  34.98 
 
 		 820 aa  166  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  34.34 
 
 		 463 aa  165  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  32.95 
 
 		 503 aa  163  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  34.38 
 
 		 454 aa  162  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  32.6 
 
 		 678 aa  161  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  33.54 
 
 		 370 aa  160  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 376 aa  159  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  34.16 
 
 		 388 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  34.06 
 
 		 451 aa  159  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  36.4 
 
 		 383 aa  157  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  32.39 
 
 		 477 aa  157  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  33.67 
 
 		 389 aa  157  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  31.81 
 
 		 520 aa  157  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 364 aa  156  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  44.56 
 
 		 2286 aa  156  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  32.63 
 
 		 756 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  33.44 
 
 		 829 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  34.17 
 
 		 309 aa  152  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  30.41 
 
 		 487 aa  152  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  32.45 
 
 		 628 aa  152  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  35.29 
 
 		 399 aa  151  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  32.59 
 
 		 457 aa  151  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  33.93 
 
 		 451 aa  151  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  35.27 
 
 		 368 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  30.45 
 
 		 373 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  34.78 
 
 		 619 aa  150  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  28.49 
 
 		 490 aa  149  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1702  Carbohydrate-binding CenC domain protein  50.33 
 
 		 224 aa  147  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0809  glycoside hydrolase family 10  27.77 
 
 		 627 aa  147  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  31.03 
 
 		 465 aa  145  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  31 
 
 		 778 aa  144  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  41.58 
 
 		 691 aa  143  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  29.93 
 
 		 375 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  31.85 
 
 		 770 aa  142  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  33.23 
 
 		 401 aa  141  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  30.19 
 
 		 387 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  33.44 
 
 		 543 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  31.42 
 
 		 370 aa  139  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  30.09 
 
 		 357 aa  138  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  34.05 
 
 		 398 aa  138  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  32.47 
 
 		 394 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  31.72 
 
 		 317 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  27.59 
 
 		 566 aa  132  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>