More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0813 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  99.74 
 
 
387 aa  788  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  789  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1315  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.42 
 
 
393 aa  312  8e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00399171 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3062  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.98 
 
 
392 aa  307  2e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0334  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.99 
 
 
396 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0480  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.15 
 
 
397 aa  288  9e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121131 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1911  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.82 
 
 
386 aa  283  2e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0885736 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1381  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.38 
 
 
386 aa  283  3e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2244  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 
395 aa  273  4e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3921  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.31 
 
 
389 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 
389 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1552  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.07 
 
 
391 aa  249  6e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
383 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
393 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1601  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.07 
 
 
384 aa  225  1e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.600148  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0053  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.92 
 
 
380 aa  221  2e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_53  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.4 
 
 
380 aa  219  6e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  3.48824e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1754  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
385 aa  217  3e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1174  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.71 
 
 
402 aa  214  2e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1760  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
402 aa  214  3e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000124402  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
382 aa  212  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 
389 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0784  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.98 
 
 
310 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  9.47408e-05 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 
382 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1710  NADH-dependent butanol dehydrogenase  35.57 
 
 
395 aa  208  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0050  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 
380 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  3.2354e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
382 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
395 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.74 
 
 
382 aa  206  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
382 aa  206  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  34.9 
 
 
382 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1915  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.38 
 
 
391 aa  205  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00162384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
382 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
395 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 
382 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0330  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
380 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.397984 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
398 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1681  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
385 aa  204  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
382 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.88 
 
 
400 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  35.09 
 
 
382 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
382 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07410  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
402 aa  202  8e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 
382 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
382 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
382 aa  201  1e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0564  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
399 aa  201  1e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00143817  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  37.05 
 
 
388 aa  201  2e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
384 aa  201  2e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  33.77 
 
 
381 aa  201  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 
395 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.54 
 
 
400 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3240  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
384 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
392 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0654  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
403 aa  199  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.38 
 
 
400 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
382 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
400 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
382 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.38 
 
 
400 aa  199  8e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 
382 aa  199  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 
382 aa  199  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 
382 aa  198  1e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4732  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
399 aa  199  1e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.942125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
388 aa  197  2e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
380 aa  197  2e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.161806 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  34.8 
 
 
382 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1911  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
399 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  9.28726e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0894  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.95 
 
 
399 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0563  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
358 aa  196  4e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.165056  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
382 aa  196  4e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
382 aa  196  4e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.52 
 
 
382 aa  196  5e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.21 
 
 
400 aa  196  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  34.3 
 
 
382 aa  196  8e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
382 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
379 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
398 aa  194  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00850  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
390 aa  193  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.17 
 
 
382 aa  193  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
402 aa  193  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
377 aa  193  5e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0139  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
404 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0578  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 
402 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0106  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
395 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00140728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 
387 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.0752e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0107  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
395 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000469096  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
383 aa  191  3e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.74 
 
 
400 aa  190  3e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.74 
 
 
400 aa  190  3e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.81233e-05 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.31 
 
 
384 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
389 aa  190  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
393 aa  189  5e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2911  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
390 aa  189  6e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1626  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  31.97 
 
 
394 aa  189  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
388 aa  189  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
383 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.35 
 
 
382 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
399 aa  186  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
382 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>